Sequence‐specific recognition but position‐dependent cleavage of two distinct telomeres by the <i>Borrelia burgdorferi</i> telomere resolvase, ResT
Notice bibliographique
Résumé
An unusual feature of bacteria in the genus Borrelia (causative agents of Lyme disease and relapsing fever) is a segmented genome consisting of multiple linear DNA molecules with covalently closed hairpin ends, known as telomeres. The hairpin telomeres are generated by a DNA breakage and reunion process (telomere resolution) promoted by ResT, an enzyme using an active site related to that of tyrosine recombinases and type IB topoisomerases. In this study, we define the minimal sequence requirements for a functional telomere and identify specific basepairs that appear to be important for telomere resolution. In addition, we show that the two naturally occurring and distinct telomere spacings found in B. burgdorferi can both be efficiently processed by ResT. This flexibility for substrate utilization by ResT supports the argument for a single telomere resolvase in Borrelia. Furthermore, although telomere recognition requires sequence specificity in part of the substrate, DNA cleavage is instead position dependent and occurs at a fixed distance from the axis of symmetry and the conserved sequence of box 3 in the different replicated telomere substrates. This positional dependence for DNA cleavage has not been observed previously for a tyrosine recombinase.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».