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Enregistrement W1559109663 · doi:10.25100/socolen.v33i2.9325

Analysis and Applications of the Molecular Typification of the Mitochondrial Genome of <i>Beauveria Bassiana</i>

2007· article· es· W1559109663 sur OpenAlexaff
Daniel Uribe, George G. Khachatourians

Notice bibliographique

RevueRevista Colombiana de Entomología · 2007
Typearticle
Languees
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueEntomopathogenic Microorganisms in Pest Control
Établissements canadiensUniversity of Saskatchewan
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBiologyHumanitiesMolecular biologyPhilosophy

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Beauveria bassiana is one of the entomopathogenic fungi most widely used world wide for the control of insect pests in the agricultural sector. Its importance from the commercial point of view has lead to the necessity to develop strategies of molecular characterization, with the aim of following the fate of strains in the field and eventually protecting those that are most commercially important. The mitochondrial genome is a tool that is appropriate for taxonomic characterization, the development of phylogenetic studies and the characterization of strains at the molecular level because it is a haploid molecule, fast evolving and with functional similarity at different taxonomic levels. In this work the mitochondrial DNA diversity of 20 strains of the entomopathogenic fungi B. bassiana were evaluated. This characterization was done by using the RFLP technique with the total mitochondrial DNA of the standard strain GK2016 digested with the restriction enzyme Hpa II as a probe. A great diversity was found, represented by the presence of 10 mito-types within the sample studied. No specific relationship was found between the patterns of mito-typification and either the geographic origin or the host. Similarly a phylogenetic analysis was conducted on several filamentous fungi species including some entomopathogenic fungi using the mitochondrial gene 16s srRNA. The analysis of these results and our interpretation of the implications for research on B. bassiana are discussed.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,720
Score d'incertitude au seuil0,337

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,002
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,004
Tête enseignante GPT0,216
Écart entre enseignants0,212 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2007
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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