Three conserved domains in the 3’UTR region of αENaC mRNA modulates the stability of the transcript in alveolar epithelial cells (716.1)
Notice bibliographique
Résumé
The epithelial sodium channel (ENaC) plays an important role in the alveolar epithelium by mediating Na + reabsorption, an essential process for resolution of pulmonary edema in acute respiratory distress syndrome (ARDS). Several proinflammatory conditions such as TNF‐α leads to a reduction of ENaC expression and activity that contributes to development of ARDS. To study how pro‐inflammatory conditions could modulate αENaC mRNA stability, we developped a Tet‐Off model that allows the specific inhibition of αENaC mRNA expression in presence of doxycycline. Using this model, we found that the half‐life (T 1/2 ) for the transcript was about 1 hr. TNF‐α, a proinflammatory cytokine found in broncho‐alveolar lavage of ARDS patients, decreased T 1/2 to 15 min, suggesting that destabilisation of αENaC transcript plays an important role in downregulation of ENaC expression in pro‐inflammatory conditions. The 3’ untranslated region (3’UTR) of a mRNA plays an important role in modulating mRNA stability. αENaC mRNA 3’UTR is very long (~30% of the transcript). Using a bioinformatic approach, we could define three domains (D1, D2, D3) able to form secondary structures that were highly conserved in different species. Alveolar epithelial cells were co‐transfected with 3’UTR deletion mutants inserted in pTRE‐tight vector along with the Tet‐Off vector. Deletion of the distal part of 3’UTR (D3) leaded to stabilization of the transcript with a T 1/2 of 2.6 hrs. A longer deletion to remove also D2 showed a T 1/2 of 4.6 hrs, while deletion of D1 decreased the half‐life to 0.5 hr. These results showed that the conserved domains have stabilizing (D1) and destabilizing (D2, D3) properties on αENaC mRNA expression. The hairpin structure of these domains could recruit RNA‐binding proteins responsible for modulation of αENaC mRNA stability. Altogether, our results suggest that modulation of αENaC mRNA stability via its 3’UTR could play an important role in regulation of ENaC expression during pro‐inflammatory conditions. Grant Funding Source : Supported by FRSQ, CFC and CIHR.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».