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Enregistrement W1561324538 · doi:10.1155/2004/238769

Quantitative Histopathological Analysis of Cervical Intra‐Epithelial Neoplasia Sections: Methodological Issues

2003· article· en· W1561324538 sur OpenAlexaff
Martial Guillaud, Dennis D. Cox, Anaís Malpica, Gregg Staerkel, Jasenka Matisic, Dirk Van Niekirk, Karen Adler‐Storthz, Neal Poulin, Michele Follen, Calum MacAulay

Notice bibliographique

RevueAnalytical Cellular Pathology · 2003
Typearticle
Langueen
DomaineComputer Science
ThématiqueAI in cancer detection
Établissements canadiensUniversity of British ColumbiaBC Cancer Agency
Organismes subventionnairesNational Cancer Institute
Mots-clésPathologyMedicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

OBJECTIVES: As part a Program Project to evaluate emerging optical technologies for cervical neoplasia, our group is performing quantitative histopathological analysis of biopsies from 1,800 patients. Several methodological issues have arisen with respect to this analysis: (1) Finding the most efficient way to compensate for staining intensity variation with out losing diagnostic information; (2) Assessing the inter- and intra-observer variability of the semi-interactive data collection; and (3) the use of non-overlapping cells from the intermediate layer only. METHODS: Non-overlapping quantitatively stained nuclei were selected from 280 samples with histopathological characteristics of normal (199), koilocytosis (37), CIN 1 (18), CIN 2 (10) and CIN 3 (16). Linear discriminant analysis was used to assess the diagnostic information in three different feature sets to evaluate and compare staining intensity normalization methods. Selected feature values and summary scores were used to evaluate intra- and inter-observer variability. RESULTS: The features normalized by the internal subset of the imaged cells had the same discriminatory power as those normalized by the control cells and by both normalization methods seem to have additional discriminatory power over the set of features which do not require normalization. The use of the internal subset decreased the image acquisition time by approximately 50% at each center, respectively. The intra- and inter-observer variability was of a similar size. Good performance was obtained by measuring the intermediate layer only. CONCLUSION: The use of intensity normalization from a subset of the imaged non-overlapping intermediate layer cells works as well as or better than any of the other methods tested and provides a significant timesaving. Our intra- and inter-observer variability do not seem to affect the diagnostic power of the data. Although this must be tested in a larger data set, the use of intermediate layer cells only may be acceptable when using quantitative histopathology.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Théorique ou conceptuel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,768
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0010,003
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,085
Tête enseignante GPT0,347
Écart entre enseignants0,262 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeThéorique ou conceptuel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations41
Publié2003
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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