MHC Class II immunoproteomic analysis of Chlamydia trachomatis and C. muridarum infected murine dendritic cells reveals overlapping immunodominant epitopes (106.7)
Notice bibliographique
Résumé
Abstract Protective immunity to Chlamydia is T cell-mediated, requiring MHC class II presented antigens. Immunodominant T cell antigens are potential human Chlamydia vaccine candidates. An immunoproteomic approach was undertaken in which Chlamydia-derived peptides presented by MHC class II molecules on the surface of infected murine dendritic cells (DCs) were identified by tandem mass spectrometry. DCs from both Balb/c and C57BL/6 mice were infected with C. muridarum and DCs from C57BL/6 were infected with C. trachomatis and C. muridarum. DCs from Balb/c infected with C. muridarum yielded 14 MHC class II binding peptides from 11 different C. muridarum proteins. Only one of the 11 proteins was shared in common with 16 C. muridarum proteins that generated MHC class II binding peptides using DCs from C57BL/6 mice. However, C57BL/6 DCs infected with C. trachomatis serovar D yielded 60 MHC class II binding peptides derived from 27 proteins, 10 of which were shared between the C. muridarum and C. trachomatis proteome. Among the 10 overlapping proteins six were tested for protective immunity and all conferred protection in mice against C. muridarum genital tract infection using DDA/MPL adjuvant. Three of the protective proteins belonged to the polymorphic membrane family of proteins, which generated MHC binding epitopes at distinct sequences within the proteins. We conclude that T cell immunodominance is determined by both MHC allelic selection and inherent properties of pathogen proteins.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».