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Enregistrement W1564187268 · doi:10.1111/trf.12285

Alleles of the <scp>LAN</scp> blood group system: molecular and serologic investigations

2013· article· en· W1564187268 sur OpenAlexaff
Marion E. Reid, Kim Hue‐Roye, Angela Huang, Randall W. Velliquette, Yoshihiko Tani, Connie M. Westhoff, Christine Lomas‐Francis, Teresa Zelinski

Notice bibliographique

RevueTransfusion · 2013
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueBlood groups and transfusion
Établissements canadiensUniversity of Manitoba
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésAlleleGeneticsBiologyAmpliconPolymerase chain reactionMissense mutationgenomic DNAGeneMolecular biologyPhenotype

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: Anti-Lan has been implicated in hemolytic transfusion reactions and hemolytic disease of the fetus and newborn. The LAN blood group system is encoded by ABCB6, whose gene product, ABCB6, belongs to the ATP-binding cassette (ABC) efflux transporter superfamily. The purpose of this study was to characterize additional alleles by analyzing DNA from 14 (13 unrelated) subjects whose red blood cells were serologically defined as Lan-, Lan+(w) /-, or Lan+(w) . STUDY DESIGN AND METHODS: Genomic DNA was extracted from blood samples recovered from liquid nitrogen storage. Intronic primers flanking each of the ABCB6 coding exons were used for polymerase chain reaction amplification. Amplicons were sequenced and analyzed by standard methods. RESULTS: Among the study subjects, we identified five alleles (one with a nonsense change, three with frameshifts, one with a missense change) that encode the Lan- phenotype and four alleles (with missense changes) encoding either Lan+(w) or Lan+(w) /- phenotypes. CONCLUSIONS: Of the nine alleles we identified, three were novel and six were previously documented in the dbSNP. Of these six, only one allele was previously associated with Lan negativity. To date, 19 ABCB6 alleles that encode Lan- or Lan+(w) /-, or Lan+(w) phenotypes have been described.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,676
Score d'incertitude au seuil0,380

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,009
Tête enseignante GPT0,196
Écart entre enseignants0,187 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations15
Publié2013
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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