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Enregistrement W1565044685 · doi:10.4049/jimmunol.179.7.4694

Early Growth Response 1 and NF-ATc1 Act in Concert to Promote Thymocyte Development beyond the β-Selection Checkpoint

2007· article· en· W1565044685 sur OpenAlexaff
Ekaterina K. Koltsova, Maria Ciofani, Robert Benezra, Toru Miyazaki, Neil A. Clipstone, Juan Carlos Zúñiga‐Pflücker, David L. Wiest

Notice bibliographique

RevueThe Journal of Immunology · 2007
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueSignaling Pathways in Disease
Établissements canadiensSunnybrook HospitalUniversity of TorontoSunnybrook Health Science Centre
Organismes subventionnairesNational Institute of Diabetes and Digestive and Kidney DiseasesNational Cancer InstituteNational Institutes of Health
Mots-clésEGR1Transcription factorBiologyCell biologyG2-M DNA damage checkpointThymocyteCD8Cancer researchNegative selectionCell cycle checkpointGeneticsApoptosisCell cycleGeneAntigenGenome

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Development of immature T cell precursors beyond the beta-selection checkpoint is regulated by signals transduced by the pre-TCR complex. The pre-TCR-induced differentiation program is orchestrated by a network of transcription factors that serve to integrate this signaling information. Among these transcription factors are those of the early growth response (Egr) and NF-AT families. In this study, we demonstrate that Egr1 and NF-ATc1 act together to promote development of T cell precursors beyond the beta-selection checkpoint to the CD8 immature single-positive and CD4+ CD8+ double-positive stages. Moreover, we find that Egr1 and NF-AT cooperatively induce the expression of inhibitor of DNA binding 3 (Id3), a regulatory factor known to play an important role in positive selection of thymocytes, but not previously demonstrated to be required for beta-selection. Importantly, we show in this study that Id3 deficiency abrogates the ability of ectopically expressed Egr1 to promote traversal of the beta-selection checkpoint. Id3 is presumably essential for traversal of the beta-selection checkpoint in this context because of the inability of other inhibitor of DNA binding family members to compensate, since transgenic Egr1 does not induce expression of inhibitor of DNA binding 1 (Id1) or 2 (Id2). Taken together, these data demonstrate that Id3 is a cooperatively induced target that is important for Egr-mediated promotion of development beyond the beta-selection checkpoint. Moreover, these data indicate that the ERK and calcium signaling pathways may converge during beta-selection through the concerted action of Egr1 and NF-ATc1, respectively.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,009
Tête enseignante GPT0,250
Écart entre enseignants0,241 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations27
Publié2007
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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