Analysis of Membrane Protein Complexes Using the Split-Ubiquitin Membrane Yeast Two-Hybrid System
Notice bibliographique
Résumé
Recent research has begun to elucidate the global network of cytosolic and membrane protein interactions. The resulting interactome map facilitates numerous biological studies, including those for cell signalling, protein trafficking and protein regulation. Due to the hydrophobic nature of membrane proteins such as tyrosine kinases, G-protein coupled receptors, membrane bound phosphatases and transporters it is notoriously difficult to study their relationship to signaling molecules, the cytoskeleton, or any other interacting partners. Although conventional yeast-two hybrid is a simple and robust technique that is effective in the identification of specific protein-protein interactions, it is limited in its use for membrane proteins. However, the split-ubiquitin membrane based yeast two-hybrid assay (MYTH) has been described as a tool that allows for the identification of membrane protein interactions. In the MYTH system, ubiquitin has been split into two halves, each of which is fused to a protein, at least one of which is membrane bound. Upon interaction of these two proteins, the two halves of ubiquitin are reconstituted and a transcription factor that is fused to the membrane protein is released. The transcription factor then enters the nucleus and activates transcription of reporter genes. Currently, large-scale MYTH screens using cDNA or gDNA libraries are performed to identify and map the binding partners of various membrane proteins. Thus, the MYTH system is proving to be a powerful tool for the elucidation of specific protein-protein interactions, contributing greatly to the mapping of the membrane protein interactome.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,002 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».