<i>rbm47</i>, a novel RNA binding protein, regulates zebrafish head development
Notice bibliographique
Résumé
BACKGROUND: Vertebrate trunk induction requires inhibition of bone morphogenetic protein (BMP) signaling, whereas vertebrate head induction requires concerted inhibition of both Wnt and BMP signaling. RNA binding proteins play diverse roles in embryonic development and their roles in vertebrate head development remain to be elucidated. RESULTS: We first characterized the human RBM47 as an RNA binding protein that specifically binds RNA but not single-stranded DNA. Next, we knocked down rbm47 gene function in zebrafish using morpholinos targeting the start codon and exon-1/intron-1 splice junction. Down-regulation of rbm47 resulted in headless and small head phenotypes, which can be rescued by a wnt8a blocking morpholino. To further reveal the mechanism of rbm47's role in head development, microarrays were performed to screen genes differentially expressed in normal and knockdown embryos. epcam and a2ml were identified as the most significantly up- and down-regulated genes, respectively. The microarrays also confirmed up-regulation of several genes involved in head development, including gsk3a, otx2, and chordin, which are important regulators of Wnt signaling. CONCLUSIONS: Altogether, our findings reveal that Rbm47 is a novel RNA-binding protein critical for head formation and embryonic patterning during zebrafish embryogenesis which may act through a Wnt8a signaling pathway.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».