A Y genome specific STS marker in<i>Pseudoroegneria</i>and<i>Elymus</i>species (Triticeae: Gramineae)Parts of this paper were derived from the thesis research that partially fulfilled the requirements of an M.S. degree earned by Mr. Pungu Okito at the Graduate School, Utah State University. This research was supported in part by the Utah Agricultural Experiment Station, Utah State University, Logan, UT 84322-4810, USA. Approved as Utah Agricultural Experiment Station journal paper No. 7973.
Notice bibliographique
Résumé
The tribe Triticeae Dumortier in the grass family (Poaceae) includes the most important cereal crops (e.g., wheat, barley, and rye) and some economically important forage grasses. Elymus L. is the largest and most complex genus in the Triticeae tribe with approximately 150 species occurring worldwide. The genomic constitutions of approximately 40% of Elymus species are unknown and some have unverified genomic combinations. Of those known for genome constitutions, Elymus species have a genomic formula of StH, StP, StY, StStY, StHY, StPY, or StWY. However, the origin of the Y genome is unknown because no diploid species have been identified as the Y genome donor. A putative Y genome specific random amplified polymorphic DNA (RAPD) marker was converted to a sequence tagged site (STS) marker. The reliability of this STS marker for confirming the presence of the Y genome was demonstrated using 42 accessions of Elymus. The STS-PCR for the Y genome marker was then assayed on 43 accessions of diploid Pseudoroegneria (Nevski) A. Löve species having the St genome to identify possible donors of the Y genome. A rare accession of Pseudoroegneria spicata (Pursh) A. Löve was found to possess sequences that most closely related to those from the tetraploid Elymus longearistatus (Boiss.) Tzvelev (StStYY), making P. spicata the most likely donor of the Y genome, although Pseudoroegneria libanotica (Heck.) D.R. Dewey or other Pseudoroegneria species could not be excluded. Our findings support the hypothesis that the Y genome in some Elymus species shares a progenitor genome (designated StY) with the St genome of Pseudoroegneria.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».