MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W1572302312 · doi:10.1002/oby.20886

Identification of two novel loss-of-function <i>SIM1</i> mutations in two overweight children with developmental delay

2014· article· en· W1572302312 sur OpenAlexaff
Louise Montagne, Anne Raimondo, Bruno Delobel, Bénédicte Duban‐Bedu, Fanny Stutzmann Noblet, Aurélie Dechaume, David C. Bersten, Stephen Eyre, Murray L. Whitelaw, Philippe Froguel, Amélie Bonnefond

Notice bibliographique

RevueObesity · 2014
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueUbiquitin and proteasome pathways
Établissements canadiensMcMaster University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésOverweightPhenotypeLoss functionGlobal developmental delayHypotoniaObesityMutationGeneticsWeight lossMedicineGeneBiologyInternal medicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

OBJECTIVE: Several deletions of chromosome 6q, including SIM1, were reported in obese patients with developmental delay. Furthermore, rare loss-of-function SIM1 mutations were shown to contribute to severe obesity, yet the role of these mutations in developmental delay remained unclear. Here, SIM1 in children with neurodevelopmental abnormalities was screened and the functional effect of the identified mutations was investigated. METHODS: SIM1 was sequenced in 283 children presenting with developmental delay and at least overweight. The effect of the identified mutations on SIM1 transcriptional activity in stable human cell lines was assessed using luciferase gene reporter assays. RESULTS: Two novel mutations (c.886A>G/p.R296G and c.925A>G/p.S309G) in two boys with variable degrees of cognitive deficits and weight issues were identified. The child mutated for p.R296G presented with a generally more severe phenotype than the p.S309G carrier (obesity, compulsive eating, neonatal hypotonia versus overweight only), while both mutations had strong loss-of-function effects on SIM1 transcriptional activity. CONCLUSIONS: Severe loss-of-function SIM1 mutations can be associated with a spectrum of developmental delay phenotypes and obesity. Our data suggest that SIM1 sequencing should be performed more systematically in patients with developmental delay, even in the absence of severe obesity. These results deserve further SIM1 screening studies.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,100
Score d'incertitude au seuil0,314

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,008
Tête enseignante GPT0,238
Écart entre enseignants0,230 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations24
Publié2014
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueObesityMême sujetUbiquitin and proteasome pathwaysTravaux en français237 207