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Enregistrement W1572374056 · doi:10.1186/s12917-015-0492-8

Macrolide-lincosamide-streptogramin resistance phenotypes and genotypes of coagulase-positive Staphylococcus aureus and coagulase-negative staphylococcal isolates from bovine mastitis

2015· article· en· W1572374056 sur OpenAlexaff
Longping Li, Weiwei Feng, Zhiping Zhang, Huping Xue, Xin Zhao

Notice bibliographique

RevueBMC Veterinary Research · 2015
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueAntimicrobial Resistance in Staphylococcus
Établissements canadiensMcGill University
Organismes subventionnairesNational Natural Science Foundation of ChinaRecruitment Program of Global ExpertsNational Science Foundation
Mots-clésDalfopristinLincosamidesMicrobiologyCoagulaseBiologyStaphylococcus aureusQuinupristinSCCmecErythromycinAgar dilutionClindamycinMethicillin-resistant Staphylococcus aureusStaphylococcusAntibioticsMinimum inhibitory concentrationGeneticsBacteriaVancomycin

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: There are limited data available on macrolide-lincosamide-streptogramin (MLS) resistance of Staphylococcus aureus (S. aureus) and coagulase-negative staphylococci (CoNS) from bovine milk in China. To address this knowledge gap, MLS resistance was determined in 121 S. aureus and 97 CoNS isolates. Minimum inhibitory concentrations (MICs) of MLS antibiotics were determined by an agar dilution method, while differentiation of MLS phenotypes was performed by a double-disc diffusion test. MLS resistance genotypes were determined by PCR for corresponding resistance genes. RESULTS: Forty (33.1%) S. aureus and 65 (67.0%) CoNS were resistant to erythromycin, whereas all 218 isolates were susceptible to quinupristin/dalfopristin. Among 40 erythromycin-resistant (ER-R) S. aureus and 65 ER-R CoNS isolates, 38 S. aureus and 40 CoNS isolates exhibited the inducible MLS (iMLS) resistance phenotype and 2 S. aureus and 20 CoNS isolates expressed the constitutive MLS resistance (cMLS) phenotype. At the same time, 5 CoNS isolates exhibited resistance to erythromycin but susceptibility to clindamycin (the MS phenotype). An inactivating enzyme gene lnu(A), methylase genes erm(C) and erm(B), efflux genes msr(A)/msr(B), a phosphotransferase gene mph(C), an esterase gene ere(A) and the streptogramin resistance determinant vga(A) were detected individually or in combinations. Among them, genes lnu(A), erm(C) and mph(C) predominated. The ereA gene was detected for the first time in staphylococci of bovine milk origin. Resistance genes also existed in erythromycin-susceptible isolates. CONCLUSIONS: Our study demonstrated a high level of resistance to MLS antibiotics in staphylococci from bovine mastitic milk, especially with a high rate of the iMLS phenotype in S. aureus isolates. These data suggest that MLS antibiotics should be used judiciously to treat or prevent bovine mastitis caused by staphylococci.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,004
Score d'incertitude au seuil0,008

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,100
Tête enseignante GPT0,361
Écart entre enseignants0,261 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations59
Publié2015
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Résumé présentoui

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