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Enregistrement W1572521274 · doi:10.1186/2194-7791-2-s1-a10

Integrated genomics elucidates relative spatial homogeneity of embryonal brain tumors

2015· article· en· W1572521274 sur OpenAlexaff
Marc Remke, Florence M.G. Cavalli, A. Sorana Morrissy, Vijay Ramaswamy, David Jones, Roger J. Packer, Éric Bouffet, Gary D. Bader, Arndt Borkhardt, Stefan M. Pfister, Nada Jabado, Marco A. Marra, Michael D. Taylor

Notice bibliographique

RevueMolecular and Cellular Pediatrics · 2015
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueGlioma Diagnosis and Treatment
Établissements canadiensMcGill University Health CentreBC Cancer AgencyUniversity of TorontoCanada's Michael Smith Genome Sciences CentreHospital for Sick Children
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésGenomicsHomogeneity (statistics)Computational biologyBiologyEvolutionary biologyMedicinePathologyBioinformaticsGeneticsGenomeGeneComputer science

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Genome-wide profiling and next-generation based sequencing studies have dramatically improved our understanding of embryonal brain tumor (EBT) biology in the recent years. However, the vast majority of these studies are based on the assumption that single biopsies are representative for the entire primary tumor. Intratumor heterogeneity constitutes a common phenomenon previously described in renal cell carcinoma (RCC) and high-grade glioma (HGG). Highly disparate molecular profiles of spatially separated tumor areas within the same tumor may preclude development of molecularly targeted therapies based on single tumor biopsies.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,530
Score d'incertitude au seuil0,648

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,013
Tête enseignante GPT0,228
Écart entre enseignants0,215 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2015
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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