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Enregistrement W1573704207 · doi:10.1111/j.1365-2672.2012.05321.x

Microelectronic-sensing assay to detect presence of Verotoxins in human faecal samples

2012· article· en· W1573704207 sur OpenAlexaff
Lijun Zhu, Biao Huang, Jiawei Chen, Stephan Gabos

Notice bibliographique

RevueJournal of Applied Microbiology · 2012
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueEscherichia coli research studies
Établissements canadiensAlberta Health ServicesNational Institute for NanotechnologyAlberta HealthUniversity of Alberta
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésVero cellCrystal violetVTECViability assayCytotoxicityEscherichia coliBiologyLysisMicrobiologyMolecular biologyCell cultureChromatographyCellChemistryBiochemistryIn vitro

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

AIMS: To develop a novel Vero cell assay that implements a real-time cell electronic sensing (RT-CES) system for the determination of the presence of verotoxin-producing Escherichia coli (VTEC). The assay overcomes the major drawbacks in conventional Vero cell assay, for example, labour-intensive and time-consuming. METHODS AND RESULTS: Cells were grown onto the surfaces of microelectronic sensors that are integrated into the bottom surfaces of the microtiter plate. Cellular viability was monitored in real-time and quantified based on changes in the sensor's electrical impedance. For cell viability measurement, the data generated on the RT-CES system correlated well with those obtained by the Vero cell assay for Verotoxins. To assess cytotoxicity, test cells growing on microelectronic sensors were treated with either supernatant from pure cultures, or stool samples. The specific neutralizing antibodies of VT1 and VT2 were used to identify specific toxins in the samples. CONCLUSIONS: The RT-CES assay provides a sensitive measurement comparable to conventional crystal violet assay. The assay has been successfully and specifically used to identify VTEC in human faecal samples. SIGNIFICANCE AND IMPACT OF THE STUDY: The RT-CES assay significantly shortens the testing time from 48 to 72 h required by the crystal violet assay to only 15 h with automated operation.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,015
Tête enseignante GPT0,285
Écart entre enseignants0,270 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations3
Publié2012
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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