MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W1573786554 · doi:10.1073/pnas.1507719112

Large-scale serum protein biomarker discovery in Duchenne muscular dystrophy

2015· article· en· W1573786554 sur OpenAlexaff
Yetrib Hathout, Edward N. Brody, Paula R. Clemens, Linda Cripe, Robert Kirk DeLisle, Pat Furlong, Heather Gordish‐Dressman, Lauren P. Hache, Erik Henricson, Eric P. Hoffman, Yvonne M. Kobayashi, Angela Lorts, Jean K. Mah, Craig M. McDonald, Bob Mehler, Sally Nelson, Malti Nikrad, Britta Swebilius Singer, Fintan R. Steele, David Sterling, H. Lee Sweeney, Larry Gold

Notice bibliographique

RevueProceedings of the National Academy of Sciences · 2015
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueMuscle Physiology and Disorders
Établissements canadiensAlberta Children's HospitalUniversity of Calgary
Organismes subventionnairesEunice Kennedy Shriver National Institute of Child Health and Human DevelopmentNational Institutes of HealthNational Center for Advancing Translational SciencesNational Institute of Arthritis and Musculoskeletal and Skin DiseasesU.S. Department of EducationNational Center for Research ResourcesU.S. Department of Defense
Mots-clésDuchenne muscular dystrophyBiomarkerMedicineBiomarker discoveryMuscular dystrophyProteomicsBioinformaticsDiseaseDystrophinNeuromuscular diseasePhenotypeInternal medicineOncologyGeneBiologyGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Serum biomarkers in Duchenne muscular dystrophy (DMD) may provide deeper insights into disease pathogenesis, suggest new therapeutic approaches, serve as acute read-outs of drug effects, and be useful as surrogate outcome measures to predict later clinical benefit. In this study a large-scale biomarker discovery was performed on serum samples from patients with DMD and age-matched healthy volunteers using a modified aptamer-based proteomics technology. Levels of 1,125 proteins were quantified in serum samples from two independent DMD cohorts: cohort 1 (The Parent Project Muscular Dystrophy-Cincinnati Children's Hospital Medical Center), 42 patients with DMD and 28 age-matched normal volunteers; and cohort 2 (The Cooperative International Neuromuscular Research Group, Duchenne Natural History Study), 51 patients with DMD and 17 age-matched normal volunteers. Forty-four proteins showed significant differences that were consistent in both cohorts when comparing DMD patients and healthy volunteers at a 1% false-discovery rate, a large number of significant protein changes for such a small study. These biomarkers can be classified by known cellular processes and by age-dependent changes in protein concentration. Our findings demonstrate both the utility of this unbiased biomarker discovery approach and suggest potential new diagnostic and therapeutic avenues for ameliorating the burden of DMD and, we hope, other rare and devastating diseases.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,205
Score d'incertitude au seuil0,201

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,027
Tête enseignante GPT0,285
Écart entre enseignants0,259 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations295
Publié2015
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueProceedings of the National Academy of SciencesMême sujetMuscle Physiology and DisordersTravaux en français237 207