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Enregistrement W1574235114 · doi:10.1111/j.1365-2672.2010.04817.x

Recombinant production of omega-3 fatty acids in Escherichia coli using a gene cluster isolated from Shewanella baltica MAC1

2010· article· en· W1574235114 sur OpenAlexafffund
Mitra Amiri-Jami, Mansel W. Griffiths

Notice bibliographique

RevueJournal of Applied Microbiology · 2010
Typearticle
Langueen
DomaineNursing
ThématiqueFatty Acid Research and Health
Établissements canadiensUniversity of Guelph
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaDairy Farmers of Ontario
Mots-clésEscherichia coliRecombinant DNAGene clusterGeneMicrobiologyCluster (spacecraft)BiologyBacteriaOmegaGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

AIM: To isolate eicosapentaenoic acid (EPA) and docosahexaenoic acid (DHA) genes from Shewanella baltica MAC1 and to examine recombinant production of EPA and DHA in E. coli to investigate cost-effective, sustainable and convenient alternative sources for fish oils. METHODS AND RESULTS: A fosmid library was prepared from the genomic DNA of S. baltica MAC1 and was screened for EPA and DHA genes by colony hybridization using a partial fragment of the S. baltica MAC1 pfaA and pfaD genes as probes. Analysis of total fatty acids isolated from transgenic E. coli positive for pfaA and pfaD genes by gas chromatography and gas chromatography-mass spectrometry indicated recombinant production of both EPA and DHA. Analysis of the complete nucleotide sequence for the isolated gene cluster showed 16 putative open reading frames (ORFs). Among those, four ORFs showed homology with pfaA, pfaB, pfaC and pfaD genes of the EPA and/or DHA biosynthesis gene clusters; however, the protein domains of these genes were different from other EPA/DHA biosynthesis genes. CONCLUSIONS: The EPA and DHA gene cluster was cloned successfully. The transgenic E. coli strain carrying the omega-3 gene cluster was able to produce both EPA and DHA. The isolated gene cluster contained all the genes required for the recombinant production of both EPA and DHA in E. coli. SIGNIFICANCE AND IMPACT OF THE STUDY: These findings have implications for any future use of the EPA and DHA gene cluster in other micro-organisms, notably those being used for fermentation. Recombinant production of both EPA and DHA by E. coli or any other micro-organism has great potential to add economic value to a variety of industrial and agricultural products.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,028
Score d'incertitude au seuil0,619

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,017
Tête enseignante GPT0,276
Écart entre enseignants0,260 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations44
Publié2010
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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