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Enregistrement W1574441420 · doi:10.3233/jad-2008-15106

Negative Regulation of AβPP Gene Expression by Pur-alpha

2008· article· en· W1574441420 sur OpenAlexaff
Nune Darbinian, Jianqi Cui, Anna Basile, Luis Del Valle, Jessica Otte, Judith Miklossy, Bassel E. Sawaya, Shohreh Amini, Kamel Khalili, Jennifer Gordon

Notice bibliographique

RevueJournal of Alzheimer s Disease · 2008
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueRNA Research and Splicing
Établissements canadiensUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesNational Institute of Neurological Disorders and Stroke
Mots-clésChromatin immunoprecipitationTranscription factorBiologyImmunoprecipitationPromoterCell biologyMolecular biologyTranscription (linguistics)GeneGene expressionGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The nucleic acid binding protein, Pur-alpha, is best characterized as a transcription factor with affinity to single stranded G/C rich regions. Pur-alpha exhibits developmental and tissue-specific regulation and plays a critical role in neuronal development and differentiation. Similar to Pur-alpha, the amyloid-beta protein precursor (AbetaPP) is a developmentally regulated protein which promotes neuronal survival. Both the human and mouse AbetaPP promoters contain multiple G/C rich sequences which regulate AbetaPP at the transcriptional and translational levels. Using an in vitro reporter assay, we confirmed that Pur-alpha consensus binding sites within the human AbetaPP promoter down-regulate AbetaPP transcription. Electrophoretic mobility shift and chromatin immunoprecipitation assays (ChIP) showed direct binding of Pur-alpha to the AbetaPP promoter. Down regulation of AbetaPP went beyond the transcriptional level as overexpression of Pur-alpha in glial and fibroblast cell lines decreased basal levels of AbetaPP while siRNA targeting Pur-alpha increased basal levels of AbetaPP. Similar findings were observed in brain tissue and fibroblasts from mice with targeted deletion of Pur-alpha. These data point to a novel mechanism of controlling AbetaPP levels by the transcriptional regulatory protein, Pur-alpha, and suggest that Pur-alpha may be involved in the dysregulation of AbetaPP in Alzheimer's disease.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,020
Tête enseignante GPT0,278
Écart entre enseignants0,259 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations20
Publié2008
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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