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Enregistrement W1575482923 · doi:10.3389/fpls.2015.00440

A cupin domain-containing protein with a quercetinase activity (VdQase) regulates Verticillium dahliae's pathogenicity and contributes to counteracting host defenses

2015· article· en· W1575482923 sur OpenAlexafffund
Abdelbasset El Hadrami, Md. Rashidul Islam, Lorne R. Adam, Fouad Daayf

Notice bibliographique

RevueFrontiers in Plant Science · 2015
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiquePlant-Microbe Interactions and Immunity
Établissements canadiensUniversity of Manitoba
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of Canada
Mots-clésVerticillium dahliaeBiologyMutantJasmonic acidRutinFlavonolsWild typeSalicylic acidMicrobiologyBotanyBiochemistryQuercetinGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

We previously identified rutin as part of potato root responses to its pathogen Verticillium dahliae. Rutin was directly toxic to the pathogen at doses greater than 160 μM, a threshold below which many V. dahliae pathogenicity-related genes were up-regulated. We identified and characterized a cupin domain-containing protein (VdQase) with a dioxygenase activity and a potential role in V. dahliae-potato interactions. The pathogenicity of VdQase knock-out mutants generated through Agrobacterium tumefasciens-mediated transformation was significantly reduced on susceptible potato cultivar Kennebec compared to wild type isolates. Fluorescence microscopy revealed a higher accumulation of flavonols in the stems of infected potatoes and a higher concentration of rutin in the leaves in response to the VdQase mutants as compared to wild type isolates. This, along with the HPLC characterization of high residual and non-utilized quercetin in presence of the knockout mutants, indicates the involvement of VdQase in the catabolism of quercetin and possibly other flavonols in planta. Quantification of Salicylic and Jasmonic Acids (SA, JA) in response to the mutants vs. wild type isolates revealed involvement of VdQase in the interference with signaling, suggesting a role in pathogenicity. It is hypothesized that the by-product of dioxygenation 2-protocatechuoylphloroglucinolcarboxylic acid, after dissociating into phloroglucinol and protocatechuoyl moieties, becomes a starting point for benzoic acid and SA, thereby interfering with the JA pathway and affecting the interaction outcome. These events may be key factors for V. dahliae in countering potato defenses and becoming notorious in the rhizosphere.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,001

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,016
Tête enseignante GPT0,215
Écart entre enseignants0,199 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations31
Publié2015
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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