FOXP3 Expression in Human Kidney Transplant Biopsies Is Associated with Rejection and Time Post Transplant but Not with Favorable Outcomes
Notice bibliographique
Résumé
Expression of the transcription factor forkhead box P3 (FOXP3) in transplant biopsies is of interest due to its role in a population of regulatory T cells. We analyzed FOXP3 mRNA expression using RT-PCR in 83 renal transplant biopsies for cause in relationship to histopathology, clinical findings and expression of pathogenesis-based transcript sets assessed by microarrays. FOXP3 mRNA was higher in rejection (T-cell and antibody-mediated) than nonrejection. Surprisingly, some native kidney controls also expressed FOXP3 mRNA. Immunostaining for FOXP3 was consistent with RT-PCR, showing interstitial FOXP3+ lymphocytes, even in some native kidney controls. FOXP3 expression correlated with interstitial inflammation, tubulitis, interstitial fibrosis, tubular atrophy, C4d positivity, longer time posttransplant, younger donors, class II panel reactive antibody >20% and transcript sets reflecting inflammation and injury, but unlike these features was time dependent. In multivariate analysis, higher FOXP3 mRNA was independently associated with rejection, T-cell-associated transcripts, younger donor age and longer time posttransplant. FOXP3 expression did not correlate with favorable graft outcomes, even when the analysis was restricted to biopsies with rejection. Thus FOXP3 mRNA expression is a time-dependent feature of inflammatory infiltrates in renal tissue. We hypothesize that time-dependent entry of FOXP3-positive cells represents a mechanism for stabilizing inflammatory sites.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».