The mental retardation gene CC2D1A/Freud‐1 encodes a long isoform that binds conserved DNA elements to repress gene transcription
Notice bibliographique
Résumé
The CC2D1A/Freud-1 gene has recently been linked to non-syndromic mental retardation and a short isoform of mouse Five prime REpressor Under Dual repression binding protein 1 (Freud-1) can repress the serotonin-1A (5-HT1A) receptor gene in rodent cells. In this study, we addressed the expression, localization and regulation of the human 5-HT1A receptor gene by a long isoform of human Freud-1 protein (Freud-1L). We show that human CC2D1A/Freud-1 RNA is expressed in brain and peripheral tissues and encodes short and long isoforms, which differ by an upstream in-frame translational start site. Whereas previous studies identified the short isoform of Freud-1 as the predominant isoform in rodent cells, we demonstrate that the long isoform is more abundant in human cells, especially in the nuclear fraction. The nuclear localization of Freud-1L was enriched upon inhibition of chromosome region maintenance 1/exportin 1-dependent nuclear export, indicating a dynamic regulation of Freud-1 nuclear localization. Consistent with a functional role in the nucleus, human Freud-1L bound specifically to its dual repressor element in the 5-HT1A receptor gene in vitro and repressed transcription from these sites. Importantly, chromatin immunoprecipitation using antibodies specific for human Freud-1L demonstrated that it is bound to the dual repressor element in chromatin, indicating a functional role in regulating the basal expression of the 5-HT1A receptor gene. Taken together, these results indicate that both the short and long isoforms of Freud-1 are expressed, although Freud-1L is the major isoform that regulates the human 5-HT1A receptor gene. Disruption of transcriptional regulation by mutation of Freud-1 may play a role in abnormal brain function leading to mental retardation.
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Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,002 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
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Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».