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Enregistrement W1576845736

International Genomic Cooperation - North American Perspective

2010· article· en· W1576845736 sur OpenAlexaboutno aff
Betsy Muir, Brian Van Doormaal, G.J. Kistemaker

Notice bibliographique

RevueBulletin - International Bull Evaluation Service/Interbull bulletin · 2010
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenetic and phenotypic traits in livestock
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésGenomic selectionGenomic informationEstimationGenomicsSNPBiotechnologyGeographyBiologyGenotypeGenomeGeneticsSingle-nucleotide polymorphismEngineering
DOInon disponible

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Centers in USA and Canada (AIPL-USDA, Animal Research Services, Beltsville, Maryland and the Canadian Dairy Network, Guelph, Ontario) have been sharing genotypes in order to enhance genomic evaluation procedures in both countries. Although genotypes and genomic methodology are shared, no direct comparison has been made between genomic breeding values published on the two country scales. January 2010 official proofs, direct genomic values and traditional EBV (termed PTA in USA) from both countries were compared. In general, genomic parent averages for young bulls were more correlated across countries than parent averages using traditional evaluations only. However, for LPI / Net Merit and Conformation, correlations across countries for first crop bulls and cows were stronger for traditional breeding values than for genomic breeding values. Accuracy of predicting future proofs was greater when all North American bulls were included in the SNP estimation, compared to only having domestic bull proofs available, with both countries realizing similar levels of accuracy. Gain in published reliability with inclusion of genomic information was greatest for young bulls and heifers evaluated in the USA, but this is also a function of differing methods used rather than differing levels of accuracy achieved with genomics. Proven bulls gained more published reliability in their second country of proof since the traditional EBV in that country would be a MACE evaluation of lower reliability so more gain is possible through genomics. This report summarizes the current benefits of collaboration in North America and challenges still to face.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict), Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesCharge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: Sans objet
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,301
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0160,003

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,012
Tête enseignante GPT0,279
Écart entre enseignants0,267 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; les deux têtes enseignantes s’accordent sur ce qui est montré ici.

Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations11
Publié2010
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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