International Genomic Cooperation - North American Perspective
Notice bibliographique
Résumé
Centers in USA and Canada (AIPL-USDA, Animal Research Services, Beltsville, Maryland and the Canadian Dairy Network, Guelph, Ontario) have been sharing genotypes in order to enhance genomic evaluation procedures in both countries. Although genotypes and genomic methodology are shared, no direct comparison has been made between genomic breeding values published on the two country scales. January 2010 official proofs, direct genomic values and traditional EBV (termed PTA in USA) from both countries were compared. In general, genomic parent averages for young bulls were more correlated across countries than parent averages using traditional evaluations only. However, for LPI / Net Merit and Conformation, correlations across countries for first crop bulls and cows were stronger for traditional breeding values than for genomic breeding values. Accuracy of predicting future proofs was greater when all North American bulls were included in the SNP estimation, compared to only having domestic bull proofs available, with both countries realizing similar levels of accuracy. Gain in published reliability with inclusion of genomic information was greatest for young bulls and heifers evaluated in the USA, but this is also a function of differing methods used rather than differing levels of accuracy achieved with genomics. Proven bulls gained more published reliability in their second country of proof since the traditional EBV in that country would be a MACE evaluation of lower reliability so more gain is possible through genomics. This report summarizes the current benefits of collaboration in North America and challenges still to face.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,005 | 0,002 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,002 | 0,005 |
| Études des sciences et des technologies | 0,003 | 0,002 |
| Communication savante | 0,005 | 0,003 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,004 |
| Intégrité de la recherche | 0,003 | 0,003 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,021 | 0,002 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».