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Enregistrement W1577472716 · doi:10.1111/j.1567-1364.2008.00377.x

Farysizyma gen. nov., an anamorphic genus in the Ustilaginales to accommodate three novel epiphytic basidiomycetous yeast species from America, Europe and Asia

2008· article· en· W1577472716 sur OpenAlexaff
João Inácio, Melissa Fontes Landell, Patrícia Valente, Pi‐Han Wang, Yen‐Ting Wang, Shan‐Hua Yang, Jessamyn S. Manson, Marc‐André Lachance, Carlos A. Rosa, Álvaro Fonseca

Notice bibliographique

RevueFEMS Yeast Research · 2008
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueYeasts and Rust Fungi Studies
Établissements canadiensWestern UniversityUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBiologyInternal transcribed spacerCladePhylogenetic treeGenusBotanyPhylogeneticsRibosomal RNATaxonomy (biology)YeastZoologyType speciesSpacer DNAGeneticsGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Among many isolates that resulted from four independent surveys of yeasts associated with plants in Brazil, the USA, Portugal and Taiwan, we have characterized eighteen basidiomycetous strains, two of which were conspecific with the type strain of Rhodotorula acheniorum, whereas the remaining sixteen isolates appeared not to correspond to any previously described species. Microsatellite-PCR fingerprinting with primers M13 and (GTG)5 confirmed that the latter strains formed three genetically distinct groups. Each group was considered to represent a distinct species based on nucleotide sequences of the D1/D2 domains of the 26S rRNA gene and the internal transcribed spacer (ITS) region. Phylogenetic analyses of sequence data placed the putative novel species in a clade with R. acheniorum and the dimorphic smut fungus Farysia chardoniana. A novel anamorphic genus, Farysizyma, is created to accommodate the three undescribed species, which were named Farysizyma itapuensis, Farysizyma setubalensis and Farysizyma taiwaniana. A new combination, Farysizyma acheniorum, is proposed for R. acheniorum, which may represent the yeast-phase anamorph of Farysia thuemenii.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,077
Tête enseignante GPT0,314
Écart entre enseignants0,236 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations32
Publié2008
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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