The Basic Helix-Loop-Helix Transcription Factor HEBAlt Is Expressed in Pro-T Cells and Enhances the Generation of T Cell Precursors
Notice bibliographique
Résumé
The basic helix-loop-helix (bHLH) transcription factors HEB and E2A are critical mediators of gene regulation during lymphocyte development. We have cloned a new transcription factor, called HEBAlt, from a pro-T cell cDNA library. HEBAlt is generated by alternative transcriptional initiation and splicing from the HEB gene locus, which also encodes the previously characterized E box protein HEBCan. HEBAlt contains a unique N-terminal coding exon (the Alt domain) that replaces the first transactivation domain of HEBCan. Downstream of the Alt domain, HEBAlt is identical to HEBCan, including the DNA binding domain. HEBAlt is induced in early thymocyte precursors and down-regulated permanently at the double negative to double positive (DP) transition, whereas HEBCan mRNA expression peaks at the DP stage of thymocyte development. HEBAlt mRNA is up-regulated synergistically by a combination of HEBCan activity and Delta-Notch signaling. Retroviral transduction of HEBAlt or HEBCan into hemopoietic stem cells followed by OP9-DL1 coculture revealed that HEBAlt-transduced precursors generated more early T lineage precursors and more DP pre-T cells than control transduced cells. By contrast, HEBCan-transduced cells that maintained high level expression of the HEBCan transgene were inhibited in expansion and progression through T cell development. HEB(-/-) fetal liver precursors transduced with HEBAlt were rescued from delayed T cell specification, but HEBCan-transduced HEB(-/-) precursors were not. Therefore, HEBAlt and HEBCan are functionally distinct transcription factors, and HEBAlt is specifically required for the efficient generation of early T cell precursors.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».