MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W1577940963 · doi:10.1111/j.1365-2958.2012.08205.x

The biofilm formation defect of a <i><scp>B</scp>acillus subtilis</i> flotillin‐defective mutant involves the protease <scp><scp>FtsH</scp></scp>

2012· article· en· W1577940963 sur OpenAlexfundno aff
Ana Yepes, Johannes Schneider, Benjamin Mielich‐Süss, Gudrun Koch, Juan Carlos García-Betancur, Kumaran S. Ramamurthi, Hera Vlamakis, Daniel López

Notice bibliographique

RevueMolecular Microbiology · 2012
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueBacterial biofilms and quorum sensing
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesInstitute of GeneticsNational Institutes of Health
Mots-clésBacillus subtilisBiofilmBiologyProteaseCell biologyLipid raftMutantExtracellular matrixBiochemistryBacteriaEnzymeSignal transductionGeneGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Biofilm formation in Bacillus subtilis requires the differentiation of a subpopulation of cells responsible for the production of the extracellular matrix that structures the biofilm. Differentiation of matrix-producing cells depends, among other factors, on the FloT and YqfA proteins. These proteins are present exclusively in functional membrane microdomains of B. subtilis and are homologous to the eukaryotic lipid raft-specific flotillin proteins. In the absence of FloT and YqfA, diverse proteins normally localized to the membrane microdomains of B. subtilis are not functional. Here we show that the absence of FloT and YqfA reduces the level of the septal-localized protease FtsH. The flotillin homologues FloT and YqfA are occasionally present at the midcell in exponentially growing cells and the absence of FloT and YqfA negatively affects FtsH concentration. Biochemical experiments indicate a direct interaction between FloT/YqfA and FtsH. Moreover, FtsH is essential for the differentiation of matrix producers and hence, biofilm formation. This molecular trigger of biofilm formation may therefore be used as a target for the design of new biofilm inhibitors. Accordingly, we show that the small protein SpoVM, known to bind to and inhibit FtsH activity, inhibits biofilm formation in B. subtilis and other distantly related bacteria.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,008
Tête enseignante GPT0,209
Écart entre enseignants0,201 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations78
Publié2012
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueMolecular MicrobiologyMême sujetBacterial biofilms and quorum sensingTravaux en français237 207