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Enregistrement W1578594552 · doi:10.1111/j.1472-765x.2010.02947.x

Assessment of real-time PCR for quantification of Legionella spp. in spa water

2010· article· en· W1578594552 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.

Notice bibliographique

RevueLetters in Applied Microbiology · 2010
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueLegionella and Acanthamoeba research
Établissements canadiensInstitut National de Santé Publique du Québec
Organismes subventionnairesAgence Française de Sécurité Sanitaire de l'Environnement et du Travail
Mots-clésLegionellaReal-time polymerase chain reactionMicrobiologyPredictive valueBiologyBacteriaVeterinary medicinePolymerase chain reactionLegionnaires' diseaseLegionella pneumophilaMedicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

AIMS: Legionella bacteria ubiquitously colonize natural freshwater and are responsible for legionellosis in humans. Several cases of legionellosis have been associated in particular with the use of whirlpool spas. The objective of this study was to verify whether real-time PCR is applicable for the quantification of Legionella spp. in spa water. METHODS AND RESULTS: The study compared concentrations obtained by real-time PCR vs that obtained by conventional culture for 101 spa water samples. For the culture method, Legionella spp. were detected and quantified in 14 of 101 samples with measured concentrations ranging from 250 to 3.5 × 10(5) CFU l(-1). With the real-time PCR method, Legionella spp. were detected and quantified in 42 of 101 samples with concentrations ranging from 1000 to 6.1 × 10(7) GU l(-1). Results revealed a significant but weak correlation (r(2) = 0.1867) between the two methods. The positive predictive value (35%) of the PCR method compared to conventional culture herein was low. In contrast, the negative predictive value was excellent, reaching 93%. CONCLUSIONS: Real-time PCR could be used as a screening tool to rapidly ascertain the absence of Legionella spp. in spa water. However, a positive result involves the need to resort to conventional culture. SIGNIFICANCE AND IMPACT OF THE STUDY: Data of this study highlighted the pros and cons of quantification of Legionella spp. in spa water with real-time PCR using a commercial quantitative PCR kit in a routine laboratory, when compared to conventional culture.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,004
Score d'incertitude au seuil0,373

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,010
Tête enseignante GPT0,272
Écart entre enseignants0,262 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle