MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W1579319363 · doi:10.4049/jimmunol.169.5.2381

FDC-SP, a Novel Secreted Protein Expressed by Follicular Dendritic Cells

2002· article· en· W1579319363 sur OpenAlexaff
Aaron J. Marshall, Quijiang Du, Kevin E. Draves, Yasufumi Shikishima, Kent T. HayGlass, Edward A. Clark

Notice bibliographique

RevueThe Journal of Immunology · 2002
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueImmunotherapy and Immune Responses
Établissements canadiensUniversity of WinnipegUniversity of Manitoba
Organismes subventionnairesNational Institute of Allergy and Infectious Diseases
Mots-clésGerminal centerFollicular dendritic cellsBiologyB cellMolecular biologyCD40Dendritic cellCell biologyChemokineAntibodyT cellAntigen-presenting cellAntigenImmune systemImmunologyIn vitroBiochemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

To define better the molecular basis for follicular dendritic cell (FDC) function, we used PCR-based cDNA subtraction to identify genes specifically expressed in primary FDC isolated from human tonsils. In this work we report the discovery of a novel gene encoding a small secreted protein, which we term FDC-SP (FDC secreted protein). The FDC-SP gene lies on chromosome 4q13 adjacent to clusters of proline-rich salivary peptides and C-X-C chemokines. Human and mouse FDC-SP proteins are structurally unique and contain a conserved N-terminal charged region adjacent to the leader peptide. FDC-SP has a very restricted tissue distribution and is expressed by activated FDCs from tonsils and TNF-alpha-activated FDC-like cell lines, but not by B cell lines, primary germinal center B cells, or anti-CD40 plus IL-4-activated B cells. Strikingly, FDC-SP is highly expressed in germinal center light zone, a pattern consistent with expression by FDC. In addition, FDC-SP is expressed in leukocyte-infiltrated tonsil crypts and by LPS- or Staphylococcus aureus Cowan strain 1-activated leukocytes, suggesting that FDC-SP can also be produced in response to innate immunity signals. We provide evidence that FDC-SP is posttranslationally modified and secreted and can bind to the surface of B lymphoma cells, but not T lymphoma cells, consistent with a function as a secreted mediator acting upon B cells. Furthermore, we find that binding of FDC-SP to primary human B cells is markedly enhanced upon activation with the T-dependent activation signals such as anti-CD40 plus IL-4. Together our data identify FDC-SP as a unique secreted peptide with a distinctive expression pattern within the immune system and the ability to specifically bind to activated B cells.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,012
Tête enseignante GPT0,210
Écart entre enseignants0,198 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations103
Publié2002
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueThe Journal of ImmunologyMême sujetImmunotherapy and Immune ResponsesTravaux en français237 207