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Enregistrement W1579675960 · doi:10.1071/rdv17n2ab263

263 IDENTIFICATION OF A NOVEL MOPT GENE IN HUMAN AND MOUSE ADULT TESTIS

2004· article· en· W1579675960 sur OpenAlexfundno aff
Yoon‐Jung Choi, Shujing Kang, J.-H. Kim

Notice bibliographique

RevueReproduction Fertility and Development · 2004
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueAnimal Genetics and Reproduction
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesSvenska Forskningsrådet FormasNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaMinistry of Agriculture, Forestry and FisheriesCanada Research ChairsSwedish Foundation for International Cooperation in Research and Higher Education
Mots-clésBiologyMolecular biologyComplementary DNAExongenomic DNAGeneIntroncDNA libraryGeneticsGenBank

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

To discover late stage germ cell-specific transcripts we prepared a cDNA library from adult testes of 35-day old mice and subtracted it with mRNA from the testes of juvenile mice. Real-time RT-PCR analysis indicated that 42 cDNA clones in the subtracted library were expressed more intensely in the adult testes than in the juvenile testes. One clone identified by subtraction is expressed preferentially in the late spermatid and is located on chromosome 17E3 in mouse and 2p22 in human. The full nucleotide and amino acid sequences of mouse and human MOPT gene are deposited in EMBL GenBank (AY367765 And AY367766). Human MOPT is spliced by 5 exons and 4 introns and encompasses 7,000 bp of genomic DNA (from bp 355 822 to 425 511) of NT-022184.13, whereas mouse MOPT is spliced by 5 exons and 4 introns and encompasses 7,382 bp of genomic DNA (from bp 6227407 to 6235588) of NT-039658.2. Because of the limited availability of human testis samples, development-dependent expression of MOPT mRNA was conducted using its mouse homologue and semiquantitative PCR. The number of cycles completed before entering the exponential growth, recorded by amplifier PE5700 for mouse MOPT, were 1.11 ± 0.23, 1.05 ± 0.04, 1.5 ± 0.2, 5.55 ± 0.65, 19.35 ± 0.65, 68.65 ± 2.15, and 185.15 ± 6.15 in W/W, postnatal day 5-, 8-, 12-, 15-, 18-, 22-, and 28-day mouse tissue samples, respectively. The difference among the three times was significant (P < 0.01, ANOVA). These results suggest that expression of MOPT gene increased from postnatal Day 5 to Day 28, indicating possible involvement in testicular development. The ORF encodes a protein containing 79 amino acid residues. A MORN motif, EGQFKDNMFHGLGTYTFPNG, was identified in the predicted protein sequence of MOPT; function of this motif is unknown. In situ hybridization of 12-week-old wild-type mouse testes using an antisense riboprobe and immuno-gold data indicated MOPT was expressed as a late spermatid and acrosome reaction. This work was supported by BK21 program.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,296
Score d'incertitude au seuil0,376

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,018
Tête enseignante GPT0,252
Écart entre enseignants0,233 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2004
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