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Enregistrement W1580614923 · doi:10.1080/07060661.2015.1053987

Characterization of<i>Phytophthora infestans</i>populations in Canada during 2012

2015· article· en· W1580614923 sur OpenAlexafffundvenueabout
H. Alkher, Md. Rashidul Islam, Champa Wijekoon, Melanie Kalischuk, L. M. Kawchuk, R. D. Peters, Khalil I. Al-Mughrabi, Kenneth L. Conn, Katherine F. Dobinson, D. Waterer, Fouad Daayf

Notice bibliographique

RevueCanadian Journal of Plant Pathology · 2015
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiquePlant Pathogens and Resistance
Établissements canadiensUniversity of SaskatchewanGovernment of New BrunswickAgriculture and Agri-Food CanadaUniversity of Manitoba
Organismes subventionnairesAgriculture and Agri-Food CanadaNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaAlberta Crop Industry Development Fund
Mots-clésPhytophthora infestansBlightBiologyGenotypeMating typePathogenBotanyHorticultureGeneticsGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The late blight pathogen (Phytophthora infestans) continues to cause major losses on potato and tomato in Canada and worldwide. An increased diversity of P. infestans and dramatic shifts in pathogen populations have occurred in Canada in recent years. In 2011, a survey identified different genotypes of P. infestans in Canada, including the new US-22, US-23 and US-24 genotypes, which were dominant in various Canadian provinces. In 2012, analysis of samples collected from infected potato and tomato plants from different regions in Canada indicated a rapid change in P. infestans populations in most provinces within a single year. For example, in Prince Edward Island, the US-8 genotype that dominated the P. infestans landscape for many years was displaced by the US-23 genotype, a phenomenon similar to that which occurred in western Canada in prior years. In British Columbia, however, US-11 and the new CA-12 were the dominant genotypes while in Ontario the tested isolates were US-22. Evidence for recombination was found, and increasing insensitivity to mefenoxam was apparent among isolates of some populations. Independent segregation of either Gpi, mating type or RG57 loci occurred in a number of the recombinant isolates, resulting in increased diversity of P. infestans populations. The unexpected change in composition of P. infestans genotypes supports the need for continued monitoring of this pathogen.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,732
Score d'incertitude au seuil0,657

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,032
Tête enseignante GPT0,193
Écart entre enseignants0,161 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations14
Publié2015
Routes d'admission4
Résumé présentoui

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