MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W1581341907 · doi:10.1002/0470028637.met251

Siderophore‐Binding Periplasmatic Protein<scp>Fhu</scp><scp>D</scp>and Related Periplasmic Binding Proteins Involved in Bacterial Iron Uptake

2004· other· en· W1581341907 sur OpenAlexaff
Karla D. Krewulak, Wolfgang Köster, Hans J. Vogel

Notice bibliographique

RevueHandbook of Metalloproteins · 2004
Typeother
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueBacterial Genetics and Biotechnology
Établissements canadiensUniversity of SaskatchewanUniversity of Calgary
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésPeriplasmic spaceSiderophoreBacterial outer membraneATP-binding cassette transporterBiochemistryTransporterFerricBacteriaChemistryInner membraneMembrane transport proteinBinding proteinTransmembrane proteinBiologyMembrane proteinMicrobiologyMembraneEscherichia coliReceptor

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract To fulfill their nutritional requirement for iron, many microorganisms synthesize low‐molecular‐weight iron‐chelating compounds called siderophores . These iron sources are transported into the gram‐negative bacterial cell via specific uptake pathways that include an outer membrane receptor, a periplasmic binding protein (PBP), and an inner membrane ATP‐binding cassette (ABC) transporter. Gram‐positive bacteria lack an outer membrane, and thus the uptake of the ferric siderophore involves a membrane‐anchored PBP and an ABC transporter. Siderophores are classified as hydroxamate, catecholate, or hydroxycarboxylate type siderophores. This review details what is currently known about the PBP, FhuD (Fhu — ferric hydroxamate uptake), involved in the uptake of hydroxamate‐type siderophores. In addition, several structurally related periplasmic binding proteins that mediate bacterial metal ion transport are also discussed.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict), Intégrité de la recherche
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,405
Score d'incertitude au seuil0,999

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0020,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0030,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,009
Tête enseignante GPT0,208
Écart entre enseignants0,199 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations2
Publié2004
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueHandbook of MetalloproteinsMême sujetBacterial Genetics and BiotechnologyTravaux en français237 207