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Enregistrement W1581341907 · doi:10.1002/0470028637.met251

Siderophore‐Binding Periplasmatic Protein<scp>Fhu</scp><scp>D</scp>and Related Periplasmic Binding Proteins Involved in Bacterial Iron Uptake

2004· other· en· W1581341907 sur OpenAlexaff
Karla D. Krewulak, Wolfgang Köster, Hans J. Vogel

Notice bibliographique

RevueHandbook of Metalloproteins · 2004
Typeother
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueBacterial Genetics and Biotechnology
Établissements canadiensUniversity of SaskatchewanUniversity of Calgary
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésPeriplasmic spaceSiderophoreBacterial outer membraneATP-binding cassette transporterBiochemistryTransporterFerricBacteriaChemistryInner membraneMembrane transport proteinBinding proteinTransmembrane proteinBiologyMembrane proteinMicrobiologyMembraneEscherichia coliReceptor

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract To fulfill their nutritional requirement for iron, many microorganisms synthesize low‐molecular‐weight iron‐chelating compounds calledsiderophores. These iron sources are transported into the gram‐negative bacterial cellviaspecific uptake pathways that include an outer membrane receptor, a periplasmic binding protein (PBP), and an inner membrane ATP‐binding cassette (ABC) transporter. Gram‐positive bacteria lack an outer membrane, and thus the uptake of the ferric siderophore involves a membrane‐anchored PBP and an ABC transporter. Siderophores are classified as hydroxamate, catecholate, or hydroxycarboxylate type siderophores. This review details what is currently known about the PBP, FhuD (Fhu — ferric hydroxamate uptake), involved in the uptake of hydroxamate‐type siderophores. In addition, several structurally related periplasmic binding proteins that mediate bacterial metal ion transport are also discussed.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Autre · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,022
Score d'incertitude au seuil0,072

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0020,002
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0220,023

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,009
Tête enseignante GPT0,208
Écart entre enseignants0,199 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreAutre

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations2
Publié2004
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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