Species Boundaries in Gregarine Apicomplexan Parasites: A Case Study—Comparison of Morphometric and Molecular Variability in <i>Lecudina</i> cf. <i>tuzetae</i> (Eugregarinorida, Lecudinidae)
Notice bibliographique
Résumé
Trophozoites of gregarine apicomplexans are large feeding cells with diverse morphologies that have played a prominent role in gregarine systematics. The range of variability in trophozoite shapes and sizes can be very high even within a single species depending on developmental stages and host environmental conditions; this makes the delimitation of different species of gregarines based on morphological criteria alone very difficult. Accordingly, comparisons of morphological variability and molecular variability in gregarines are necessary to provide a pragmatic framework for establishing species boundaries within this diverse and poorly understood group of parasites. We investigated the morphological and molecular variability present in the gregarine Lecudina cf. tuzetae from the intestines of Nereis vexillosa (Polychaeta) collected in two different locations in Canada. Three distinct morphotypes of trophozoites were identified and the small subunit (SSU) rDNA was sequenced either from multicell isolates of the same morphotype or from single cells. The aim of this investigation was to determine whether the different morphotypes and localities reflected phylogenetic relatedness as inferred from the SSU rDNA sequence data. Phylogenetic analyses of the SSU rDNA demonstrated that the new sequences did not cluster according to morphotype or locality and instead were intermingled within a strongly supported clade. A comparison of 1,657 bp from 45 new sequences demonstrated divergences between 0% and 3.9%. These data suggest that it is necessary to acquire both morphological and molecular data in order to effectively delimit the "clouds" of variation associated with each gregarine species and to unambiguously reidentify these species in the future.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,002 | 0,002 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,001 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».