Recombinant mouse prion protein alone or in combination with lipopolysaccharide alters expression of innate immunity genes in the colon of mice
Notice bibliographique
Résumé
The objectives of this study were to test whether recombinant mouse (mo)PrP alone or in combination with LPS or under simulated endotoxemia would affect expression of genes related to host inflammatory and antimicrobial responses. To test our hypotheses colon tissues were collected from 16 male mice (FVB/N strain) and mounted in an Ussing chamber. Application of moPrP to the mucosal side of the colon affected genes related to TLR- and NLR- signaling and antimicrobial responses. When LPS was added on the mucosal side of the colon, genes related to TLR, Nlrp3 inflammasome, and iron transport proteins were over-expressed. Addition of LPS to the serosal side of the colon up-regulated genes related to TLR- and NLR-signaling, Nlrp3 inflammasome, and a chemokine. Treatment with both moPrP and LPS to the mucosal side of the colon upregulated genes associated with TLR, downstream signal transduction (DST), inflammatory response, attraction of dendritic cells to the site of inflammation, and the JNK-apoptosis pathway. Administration of moPrP to the mucosal side and LPS to the serosal side of the colon affected genes related to TLR- and NLR-signaling, DST, apoptosis, inflammatory response, cytokines, chemokines, and antimicrobial peptides. Overall this study suggests a potential role for moPrP as an endogenous 'danger signal' associated with activation of colon genes related to innate immunity and antibacterial responses.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».