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Enregistrement W1581999026 · doi:10.1007/978-3-319-28755-3_13

Exons and Introns

2016· book-chapter· en· W1581999026 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.

Notice bibliographique

RevueEvolutionary Bioinformatics · 2016
Typebook-chapter
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueRNA and protein synthesis mechanisms
Établissements canadiensQueen's University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésIntronGeneBiologyGenomeExonGeneticsComputational biologySequence (biology)Evolutionary biology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

If genome space is finite with little, if any, DNA that is not functional under some circumstance, then potential conflicts between different forms of genomic information must be resolved by appropriate trade-offs. These trade-offs sometimes require that genes accommodate spacers, introns, and simple sequence elements. The nature and extent of the trade-offs varies with the biological species. Study of trade-offs is facilitated in genes or species where demands are exceptional (e.g. genes under positive selection pressure to adapt proteins, genes that overlap, and species under extreme downward or upward GC-pressures). Spacers and introns are likely to have existed early in evolution because they are preferential sites for the stem-loop structures that are necessary for initiating recombination and, hence, error-detection and correction. Genes, as recognized today, would have arisen in sequences already adapted for these purposes. Purine-loading pressure would have supported protein-pressure in provoking the splitting into introns of what might otherwise have been large exons. From this perspective we can understand why the genes of the malaria parasite are extraordinarily long, and we can identify the potential Achilles heel of the AIDS virus as the dimer-linkage sequence that is essential for the copackaging of disparate genomes, so allowing recombination repair in a future host.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Autre · Signal consensuel: Autre
Score de désaccord entre enseignants0,800
Score d'incertitude au seuil0,894

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,009
Tête enseignante GPT0,203
Écart entre enseignants0,194 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle