What the bovine genome project means to New Zealand
Notice bibliographique
Résumé
The sequencing of the bovine genome commenced in December 2003 and sequencing is planned to achieve a seven-fold coverage by November 2005. This along with previous physical mapping efforts will allow a high quality genomic assembly to be produced. The sequencing is being undertaken by Baylor College of Medicine in Texas. Separately, the Michael Smith Genome Science Centre in Vancouver will sequence 10,000 full length non-redundant bovine mRNAs. The assembled genome will be annotated in collaboration with the Ensembl project at the Sanger Institute, UK, and will be publicly available on genome browsers such as NCBI, Ensembl and UCSC. In the interim the raw sequence information is being made available at NCBI within days of being generated. As well as providing DNA sequence, the program will identify more than 50,000 microsatellites and one to two million SNPs. The availability of this information will transform and accelerate ruminant genomics research. Similar genome sequencing efforts in human and laboratory species have greatly increased the rate of gene variant discovery underlying quantitative trait loci. It will also aid our understanding of gene expression control. New Zealand stands to benefit directly from this work, because of its strong reliance on grazing livestock for export income and its internationally competitive beef and dairy industries. The project is funded by an international consortium involving CSIRO Australia, Genome Canada, New Zealand, National Human Genome Research Institute of the U.S. national Institutes of Health (NHGRI), U.S. Department of Agriculture (USDA), the State of Texas, The Kleberg Foundation, U.S. Beef Council, and Texas and South Dakota Beef Councils. Significantly, the National Institutes of Health have strongly supported the project as a consequence of its human health implications. This project benefited greatly from a previous international genomic collaboration to physically map the bovine genome, and it provides an excellent example of benefits obtained from international research consortia co-investing in public domain infrastructural projects.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,004 | 0,012 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,002 | 0,004 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,002 |
| Communication savante | 0,004 | 0,004 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,002 |
| Intégrité de la recherche | 0,002 | 0,003 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,022 | 0,006 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».