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Enregistrement W1583701773 · doi:10.1111/j.1471-4159.2012.07676.x

Hypoxia regulation of ATP13A2 (PARK9) gene transcription

2012· article· en· W1583701773 sur OpenAlexafffund
Qian Xu, Hongling Guo, Xiaojie Zhang, Beisha Tang, Fang Cai, Weihui Zhou, Weihong Song

Notice bibliographique

RevueJournal of Neurochemistry · 2012
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueAutophagy in Disease and Therapy
Établissements canadiensUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchChina Scholarship CouncilCanada Research ChairsUniversity of Pittsburgh
Mots-clésGeneTranscription factorBiologyGeneticsRegulation of gene expressionExonGene expressionTranscription (linguistics)PromoterCell biology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Parkinson's disease (PD) is the second most common neurodegenerative disorders with a variable combination of motor and non-motor symptoms. Mutations in several genes including ATP13A2 (PARK9) are reported to be associated with PD. The underlying mechanism of PD is not well defined, however, both genetic and environmental causes contribute to it. ATP13A2 gene locates in chromosome 1 and contains 29 exons encoding for a protein of 1180 amino acids with 10 transmembrane domains. Abnormal gene expression has been implicated in neurodegenerative disorders. The transcriptional regulation of the ATP13A2 gene is unknown. In this report, we cloned and functionally characterized the human ATP13A2 gene promoter. We showed that the promoter region of the human ATP13A2 gene contains hypoxia response elements which can bind to transcription factor hypoxia-inducible factor 1α (HIF-1α). Hypoxia up-regulated ATP13A2 transcription via HIF-1α in HEK293 and dopaminergic MN9D cells. Our study indicates that hypoxia signaling plays a very important role in the regulation of human ATP13A2 gene expression. Further study is needed to determine the role of hypoxia in the pathogenesis of PD and its interaction with other PD causative genes, which will provide insights to the role of hypoxia and dysregulation of gene expression in Parkinson's disease.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,020
Tête enseignante GPT0,268
Écart entre enseignants0,248 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations34
Publié2012
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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