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Enregistrement W1584020235 · doi:10.1111/j.1462-2920.2011.02564.x

Overlapping and unique contributions of two conserved polysaccharide loci in governing distinct survival phenotypes in <i>Vibrio vulnificus</i>

2011· article· en· W1584020235 sur OpenAlexafffund
Yunzhi Guo, Dean A. Rowe‐Magnus

Notice bibliographique

RevueEnvironmental Microbiology · 2011
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueVibrio bacteria research studies
Établissements canadiensHealth Sciences CentreSunnybrook Health Science CentreUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchHealth CanadaNational Institutes of Health
Mots-clésBiofilmBiologyVibrio vulnificusLocus (genetics)PhenotypeMicrobiologyVibrioGeneticsGeneBacteria

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

As an aetiological agent of bacterial sepsis and wound infections, Vibrio vulnificus is unique among the Vibrionacea. Its continued environmental persistence and transmission are bolstered by its ability to colonize shellfish and form biofilms on various marine biotic surfaces. We previously identified a polysaccharide locus, brp, which contributes to the survival phenotypes of biofilm formation, rugose colony formation and stress resistance. Here, we describe a second polysaccharide locus, rbd (regulation of biofilm development), which also enhanced biofilm formation when expressed. Despite this functional overlap, the development of stress resistance and rugosity could be uniquely attributed to brp expression, whereas rbd expression augmented aggregate formation. Simultaneous expression of both loci led to the formation of a dramatic pellicle and maximum biofilm formation. Unlike the brp locus, transcription of the rbd locus was regulated not by c-di-GMP, but by a response regulator (RbdG) that was encoded within the locus. We propose that the ability to regulate the expression of polysaccharides with overlapping and unique characteristics in response to different environmental cues enables V. vulnificus to 'fine tune' its biofilm lifestyle to the prevailing environmental conditions and maximally benefit from the characteristics associated with each polysaccharide.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,112
Score d'incertitude au seuil0,616

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,011
Tête enseignante GPT0,233
Écart entre enseignants0,222 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations27
Publié2011
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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