Spectroscopic characterization of the conformational adaptability of <i>Bombyx mori</i> apolipophorin III
Notice bibliographique
Résumé
Apolipophorin III (apoLp-III) from the silkmoth, Bombyx mori, has been over-expressed in Escherichia coli, purified and characterized. Far-UV CD spectroscopic analysis revealed 65% alpha-helix secondary structure. Near-UV CD spectra obtained in buffer or complexed with dimyristoylglycerophosphocholine (DMPC), provided evidence that apoLp-III alpha-helices reorient upon interaction with lipid, indicative of a protein conformational change. In guanidine hydrochloride (GdnHCl) denaturation studies, a transition midpoint of 0.33 M was observed, corresponding to a DeltaGDH2O = 2.46 kcal. mol-1. Fluorescence studies of the sole tryptophan residue (Trp40) in apoLp-III revealed an emission lambdamax = 327 nm. Compared to free tryptophan, Stern-Volmer constants (KSV) for acrylamide and KI quenching of Trp40 fluorescence were decreased by 20-fold and sevenfold, respectively. In studies of apoLp-III-DMPC disc complexes, far-UV CD spectroscopy revealed an increase in alpha-helix content to approximately 85% and a ninefold increase in the GdnHCl-induced denaturation transition midpoint to 3 M. In studies of lipid interaction, apoLp-III was shown to disrupt both negatively charged and zwitterionic phospholipid bilayer vesicles, transforming them into discoidal complexes. Characterization of apoLp-III-DMPC discs, using 5-doxyl or 12-doxyl stearic acid as lipid-based quenching agents, revealed that Trp40 localizes near the phospholipid polar head groups. KSV values for acrylamide and KI quenching of intrinsic fluorescence of apoLp-III-DMPC discs indicate that Trp40 is embedded in the lipid milieu, with little or no accessibility to the aqueous quenchers. Given the large amount of alpha-helix in apoLp-III, the data presented support a model in which amphipathic alpha-helical segments are stabilized by helix-helix interactions and lipid association induces a protein conformational change which results in substitution of helix-helix interactions for helix-lipid contacts.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».