Surveying Diverse <i>Zea</i> Seed for Populations of Bacterial Endophytes
Notice bibliographique
Résumé
Endophytes are nonpathogenic microbes that inhabit plants. We asked whether bacterial endophytes were conserved in the agriculturally important plant genus Zea as it was domesticated from its wild ancestors (teosintes) to modern maize (corn) and shifted from Mexico to Canada. Kernels from populations of diverse teosintes and maize varieties were screened for bacterial endophytes by culturing, cloning, and DNA fingerprinting using terminal-restriction fragment length polymorphism (TRFLP) of 16S rDNA. Principle component analysis (PCA) of TRFLP data demonstrated that seed endophyte community composition covaries with plant host phylogeny. This result suggests that as humans bred maize plants, they gradually also altered their microbial communities. Interestingly, a core microbiota of endophytes was identified that was conserved in Zea seed across boundaries of evolution, ethnography, and ecology. Consistent with this observation, the majority of seed endophytes in the wild ancestor were found to persist in domesticated maize. Use of GFP-tagged endophytes showed that a subset of seed endophytes could spread systemically through the plant. The seed isolate, Enterobacter asburiae, was able to exit the root and colonize the rhizosphere. We discuss the conservation and diversity of these endophytes in relation to their Zea hosts.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».