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Enregistrement W1590498065 · doi:10.1111/j.1365-2141.2011.08810.x

<i>NUP98‐HOXA9</i>‐transgenic zebrafish develop a myeloproliferative neoplasm and provide new insight into mechanisms of myeloid leukaemogenesis

2011· article· en· W1590498065 sur OpenAlexafffund
A. Michael Forrester, Clemens Grabher, Eileen McBride, Ellen R. Boyd, Märta H. Vigerstad, Alexander Edgar, FuiBoon Kai, Sahar Da’as, Elspeth Payne, A. Thomas Look, Jason N. Berman

Notice bibliographique

RevueBritish Journal of Haematology · 2011
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueZebrafish Biomedical Research Applications
Établissements canadiensIzaak Walton Killam Health CentreDalhousie University
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésMyeloproliferative neoplasmZebrafishHaematopoiesisBiologyMyeloidCancer researchTransgeneEmbryonic stem cellProgenitor cellCarcinogenesisMyeloproliferative DisordersDownregulation and upregulationStem cellMyelofibrosisImmunologyCell biologyBone marrowCancerGeneticsGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

NUP98-HOXA9 [t(7;11) (p15;p15)] is associated with inferior prognosis in de novo and treatment-related acute myeloid leukaemia (AML) and contributes to blast crisis in chronic myeloid leukaemia (CML). We have engineered an inducible transgenic zebrafish harbouring human NUP98-HOXA9 under the zebrafish spi1(pu.1) promoter. NUP98-HOXA9 perturbed zebrafish embryonic haematopoiesis, with upregulated spi1 expression at the expense of gata1a. Markers associated with more differentiated myeloid cells, lcp1, lyz, and mpx were also elevated, but to a lesser extent than spi1, suggesting differentiation of early myeloid progenitors may be impaired by NUP98-HOXA9. Following irradiation, NUP98-HOXA9-expressing embryos showed increased numbers of cells in G2-M transition compared to controls and absence of a normal apoptotic response, which may result from an upregulation of bcl2. These data suggest NUP98-HOXA9-induced oncogenesis may result from a combination of defects in haematopoiesis and an aberrant response to DNA damage. Importantly, 23% of adult NUP98-HOXA9-transgenic fish developed a myeloproliferative neoplasm (MPN) at 19-23 months of age. In summary, we have identified an embryonic haematopoietic phenotype in a transgenic zebrafish line that subsequently develops MPN. This tool provides a unique opportunity for high-throughput in vivo chemical modifier screens to identify novel therapeutic agents in high risk AML.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,008

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,016
Tête enseignante GPT0,250
Écart entre enseignants0,233 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations70
Publié2011
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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