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Enregistrement W1591268973 · doi:10.1046/j.1432-1033.2002.03270.x

Restoring enzyme activity in nonfunctional low erucic acid <i>Brassica napus</i> fatty acid elongase 1 by a single amino acid substitution

2002· article· en· W1591268973 sur OpenAlexaff
Vesna Katavić, Elzbieta Mietkiewska, Dennis L. Barton, E. Michael Giblin, Darwin W. Reed, David C. Taylor

Notice bibliographique

RevueEuropean Journal of Biochemistry · 2002
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueLipid metabolism and biosynthesis
Établissements canadiensAgriculture and Agri-Food CanadaPlant Biotechnology Institute
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBrassicaErucic acidSubstitution (logic)Fatty acidEnzymeChemistryBiochemistryBotanyBiologyComputer science

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Genomic fatty acid elongation 1 (FAE1) clones from high erucic acid (HEA) Brassica napus, Brassica rapa and Brassica oleracea, and low erucic acid (LEA) B. napus cv. Westar, were amplified by PCR and expressed in yeast cells under the control of the strong galactose-inducible promoter. As expected, yeast cells expressing the FAE1 genes from HEA Brassica spp. synthesized very long chain monounsaturated fatty acids that are not normally found in yeast, while fatty acid profiles of yeast cells expressing the FAE1 gene from LEA B. napus were identical to control yeast samples. In agreement with published findings regarding different HEA and LEA B. napus cultivars, comparison of FAE1 protein sequences from HEA and LEA Brassicaceae revealed one crucial amino acid difference: the serine residue at position 282 of the HEA FAE1 sequences is substituted by phenylalanine in LEA B. napus cv. Westar. Using site directed mutagenesis, the phenylalanine 282 residue was substituted with a serine residue in the FAE1 polypeptide from B. napus cv. Westar, the mutated gene was expressed in yeast and GC analysis revealed the presence of very long chain monounsaturated fatty acids (VLCMFAs), indicating that the elongase activity was restored in the LEA FAE1 enzyme by the single amino acid substitution. Thus, for the first time, the low erucic acid trait in canola B. napus can be attributed to a single amino acid substitution which prevents the biosynthesis of the eicosenoic and erucic acids.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,013
Tête enseignante GPT0,198
Écart entre enseignants0,185 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations84
Publié2002
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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