The human invariant chain p35 favors formation of nonameric complexes with MHC class II molecules (107.1)
Notice bibliographique
Résumé
Abstract The invariant chain (Ii) associates with MHCII alpha beta (αβ) chains after biosynthesis. Although previous studies described (αβIi)3 nonameric complexes, a recent report suggested that Ii trimers could only bind a single MHCII heterodimer at once. (Roche et al, 1991, Koch et al, 2011) We have investigated this discrepancy in the context of two human Ii isoforms, p33 and p35. The latter includes an ER retention motif (RXR) that is masked by MHCII β cytoplasmic tail upon its association with Ii. Using transfected HEK293T cells and flow cytometry, we monitored ER egress of various combinations of MHCII and Ii variants. First, we showed that MHCII only masked Ii RXR motif if associated directly (in cis) to the p35 subunit. Second, our results indicated that while p33 homotrimers may exit the ER as pentamer with one MHCII, p35-p33 mixed-trimers require cis masking of every Ii RXR motif before egress, thereby favoring heptamers and nonamers formation. Indeed, sucrose gradient of cell extracts confirmed larger complexes with p35 compared to p33. Altogether, our data argue for a kinetic model in which p33 homotrimers are free to exit the ER at any time, independently of the number of associated MHCII. In contrast, ER retention of Ii trimer containing p35 allows for binding of multiple MHCII until every RXR motifs are inactivated.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».