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Enregistrement W1592139871 · doi:10.1096/fasebj.28.1_supplement.836.5

Cleavage of DAP5 by coxsackievirus B3 protease 2A causes its nuclear translocation and inhibition of IRES‐containing gene transcription (836.5)

2014· article· en· W1592139871 sur OpenAlexafffundabout
Paul Hanson, Ye Qiu, Xin Ye, Huifang Mary Zhang, Maged Gomaa Hemida, Travis Lim, Alina Gu, Brian C. Cho, Hye-In Kim, Decheng Yang

Notice bibliographique

RevueThe FASEB Journal · 2014
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueViral Infections and Immunology Research
Établissements canadiensUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésInternal ribosome entry siteBiologyCleavage (geology)Cell biologyProteaseViral replicationTranscription factorViral MyocarditisProteasesVirologyEIF4GGeneTranslation (biology)GeneticsVirusMessenger RNA

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Coxsackievirus B3 (CVB3) is a primary causative agent of viral myocarditis which may progress to dilated cardiomyopathy (DCM), a leading cause of unexpected death in children and young adults. Upon infection, CVB3 hijacks host cellular translation machinery, generating an environment that favors viral replication. Death associated protein 5 (DAP5) is an internal ribosomal entry site (IRES) specific translation initiation factor, utilized by the cell in conditions of stress, differentiation, cell‐cycle and apoptosis. We previously showed that DAP5 is cleaved during CVB3 infection. In this study we aimed to identify the responsible protease and site of cleavage, as well as the functional impact. Our results found that DAP5 was cleaved by viral protease 2A but not by cellular proteases. We further identified the cleavage site at amino acid G434. Upon cleavage, the N‐terminal product could translocate to the nucleus and inhibited transcription of IRES‐containing pro‐survival genes such as Bcl‐2, GRP‐78 and VEGF. This is the first report to reveal the function and mechanism of DAP5 cleavage in regulating viral and host gene expression during CVB3 infection. Moreover, this study may identify key components necessary for facilitating viral pathogenesis and thus provide novel pharmaceutical targets for viral myocarditis. Grant Funding Source : Canadian Institutes of Health Research

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,006

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,030
Tête enseignante GPT0,281
Écart entre enseignants0,251 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2014
Routes d'admission3
Résumé présentoui

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