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Enregistrement W1592395964 · doi:10.1126/science.aaa4788

Genomic signatures of evolutionary transitions from solitary to group living

2015· article· en· W1592395964 sur OpenAlexafffund
Karen M. Kapheim, Hailin Pan, Cai Li, Steven L. Salzberg, Daniela Puiu, Tanja Magoč, Hugh M. Robertson, Matthew E. Hudson, Aarti Venkat, Brielle J. Fischman, Álvaro González Hernández, Mark Yandell, Daniel Ence, Carson Holt, George D. Yocum, William P. Kemp, Jordi Bosch, Robert M. Waterhouse, Evgeny M. Zdobnov, Eckart Stolle, Frank Bernhard Kraus, Sophie Helbing, Robin F. A. Moritz, Karl M. Glastad, Brendan G. Hunt, Michael A. D. Goodisman, Frank Hauser, Cornelis J.P. Grimmelikhuijzen, Daniel Guariz Pinheiro, Francis Morais Franco Nunes, Michelle Prioli Miranda Soares, Erica D. Tanaka, Zilá Luz Paulino Simões, Klaus Hartfelder, Jay D. Evans, Seth M. Barribeau, Reed M. Johnson, Jonathan H. Massey, Bruce R. Southey, Martin Hasselmann, Daniel Hamacher, Matthias Biewer, Clement F. Kent, Amro Zayed, Charles Blatti, Saurabh Sinha, J. Spencer Johnston, Shawn J. Hanrahan, Sarah D. Kocher, Jun Wang, Gene E. Robinson, Guojie Zhang

Notice bibliographique

RevueScience · 2015
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueEvolution and Genetic Dynamics
Établissements canadiensYork University
Organismes subventionnairesBeijing Institute of Genomics, Chinese Academy of SciencesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaSwiss Institute of BioinformaticsNational Institutes of HealthNational Science FoundationLundbeckfondenHoward Hughes Medical InstituteDanmarks Frie ForskningsfondSchweizerischer Nationalfonds zur Förderung der Wissenschaftlichen Forschung
Mots-clésGroup (periodic table)Evolutionary biologyBiologyGeneticsComputational biologyPhysics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The evolution of eusociality is one of the major transitions in evolution, but the underlying genomic changes are unknown. We compared the genomes of 10 bee species that vary in social complexity, representing multiple independent transitions in social evolution, and report three major findings. First, many important genes show evidence of neutral evolution as a consequence of relaxed selection with increasing social complexity. Second, there is no single road map to eusociality; independent evolutionary transitions in sociality have independent genetic underpinnings. Third, though clearly independent in detail, these transitions do have similar general features, including an increase in constrained protein evolution accompanied by increases in the potential for gene regulation and decreases in diversity and abundance of transposable elements. Eusociality may arise through different mechanisms each time, but would likely always involve an increase in the complexity of gene networks.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,009
Tête enseignante GPT0,247
Écart entre enseignants0,237 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations435
Publié2015
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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