Genetic and genomic analysis of superovulatory response in Canadian Holsteins
Notice bibliographique
Résumé
Superovulation of dairy cattle is frequently used in Canada. The cost of this protocol is high, and so is the variability of the outcome. Knowing the superovulatory potential of a donor cow could influence the breeder’s decision to superovulate it or not. The main objective of this study was to perform a genetic and genomic analysis for superovulatory response of Holstein cows in Canada, using data recorded by Holstein Canada. Data contained the total number of embryos and the number of viable embryos from every successful flushing performed across Canada. After editing, 137,446 records of superovulation done between 1992 and 2014 were considered for the analysis. A univariate repeatability animal model analysis was performed for both total number of embryos and number of viable embryos. As both data and residuals for total number of embryos and number of viable embryos did not follow a normal distribution, records were transformed using either logarithm transformation or Anscombe transformation. Using log transformation heritability estimates (SE) of 0.15 (0.01) and 0.14 (0.01) were found for total number of embryos and number of viable embryos, respectively. Using Anscombe transformation the heritability estimates (SE) were 0.17 (0.01) and 0.14 (0.01) for total number of embryos and number of viable embryos, respectively. Estimated breeding values of sires with reliabilities higher than 40% were used for calculating correlations between estimated breeding values and other routinely evaluated traits. The results showed that selection for a higher response to superovulation would lead to a slight decrease in production, but an improvement for functional traits, including all reproduction traits, however in all cases the estimated correlations are either low or modest. Considering the results obtained in this study, genetic selection for increased superovulatory response in donors is possible. Preliminary results from a genome-wide association study showed that one big region on chromosome 11 seems to be associated with superovulatory response, but more research is needed to confirm this finding.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,002 | 0,004 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».