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Enregistrement W1594975479 · doi:10.1007/978-1-62703-502-6_9

Unusual Members of the PVC Superphylum: The Methanotrophic Verrucomicrobia Genus “Methylacidiphilum”

2013· book-chapter· en· W1594975479 sur OpenAlexaff
Christine E. Sharp, Huub J. M. Op den Camp, Ivica Tamaš, Peter F. Dunfield

Notice bibliographique

RevueHumana Press eBooks · 2013
Typebook-chapter
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueMicrobial metabolism and enzyme function
Établissements canadiensUniversity of Calgary
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésVerrucomicrobiaAutotrophBiologyPhylumBacteriaProteobacteriaGenusEcologyMicrobiologyPaleontology16S ribosomal RNA

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Aerobic methanotrophic bacteria can use methane as their sole energy source. Most known species belong to the phylum Proteobacteria. One exception is a group of thermoacidophilic methanotrophic bacteria belonging to the phylum Verrucomicrobia. Although not yet taxonomically validated, these bacteria have been described physiologically and genomically and given the tentative genus name “Methylacidiphilum.” They are found in geothermal environments with moderate to high temperatures (up to 65 °C) and high acidities (down to pH 1). The genetic pathways conferring a methanotrophic lifestyle in verrucomicrobial methanotrophs are similar to their proteobacterial counterparts, although rather than fixing carbon derived from methane, they are autotrophs obtaining carbon via the Calvin-Benson-Bassham cycle. Lateral gene transfer appears to have played a major role in shaping the genomes of “Methylacidiphilum” spp. The following chapter summarizes what we presently know about them.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,012
Score d'incertitude au seuil0,040

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0120,008

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,025
Tête enseignante GPT0,216
Écart entre enseignants0,191 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations19
Publié2013
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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