MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W1596758831 · doi:10.1074/jbc.m700527200

Sp-1 Binds Promoter Elements That Are Regulated by Retinoblastoma and Regulate CTP:Phosphocholine Cytidylyltransferase-α Transcription

2007· article· en· W1596758831 sur OpenAlexaff
Claudia Banchio, Susanne Lingrell, Dennis E. Vance

Notice bibliographique

RevueJournal of Biological Chemistry · 2007
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueCancer-related Molecular Pathways
Établissements canadiensUniversity of AlbertaCanadian Institutes of Health Research
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésRetinoblastomaPromoterTranscriptional regulationTranscription (linguistics)PhosphocholineRetinoblastoma proteinBiologyGeneTranscription factorRegulation of gene expressionTransfectionMolecular biologyResponse elementGene expressionCell biologyCell cycleGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The retinoblastoma (Rb) protein is implicated in transcriptional regulation of at least five cellular genes. Co-transfection of Rb and truncated promoter constructs has defined a discrete element (retinoblastoma control element (RCE)) within the promoters of each of these genes as being necessary for Rb-mediated transcriptional control. In the present report we demonstrate that two RCEs identified within the CTP:phosphocholine cytidylyltransferase-alpha (CTalpha) proximal promoter are essential to promote transcription. Mutations that abolished each RCE markedly decreased CTalpha transcription. Co-transfection of Rb and truncated promoter constructs demonstrated that Rb regulates CTalpha expression by different mechanisms depending on the phase of the cell cycle. The regulation of CTalpha expression by Rb required both the Sp1 and the RCEs. Maximal expression occurred when both Rb and Sp1 were overexpressed. Moreover, RCEs were required for Rb association with the DNA. This regulatory mechanism alters CTalpha activity and thereafter changes PC availability and cell physiology. This is the first report demonstrating not only that surrounding Sp1 binding sites alter regulation mediated by Rb, but also that the expression of a gene involved in PC biosynthesis shares a common regulatory pathway with genes responsible for cell growth and differentiation.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,007

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,017
Tête enseignante GPT0,246
Écart entre enseignants0,229 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations18
Publié2007
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueJournal of Biological ChemistryMême sujetCancer-related Molecular PathwaysTravaux en français237 207