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Enregistrement W1597716123 · doi:10.30906/1026-2296-2009-16-2-107-118

Are Toad-Headed Lizards Phrynocephalus przewalskii and P. frontalis (Family Agamidae) the Same Species? Defining Species Boundaries with Morphological and Molecular Data

2011· article· en· W1597716123 sur OpenAlexaff
Agnes Gozdzik, Jinzhong Fu

Notice bibliographique

RevueRussian Journal of Herpetology · 2011
Typearticle
Langueen
DomaineEnvironmental Science
ThématiqueSpecies Distribution and Climate Change
Établissements canadiensUniversity of Guelph
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBiologyPhylogenetic treeMitochondrial DNAEvolutionary biologyZoologyMantel testCladeGeneticsGenetic variationGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Toad-headed lizards of the Phrynocephalus przewalskii complex provide a challenging case for delimiting species boundaries. We tested the species status of P. przewalskii and P. frontalis using mitochondrial DNA (mtDNA) sequence and morphological data. A phylogenetic analysis was applied to the mtDNA data and principal component analysis (PCA) was applied to the morphological data. Furthermore, Mantel tests were used to test congruence between the patristic distance matrix derived from the phylogenetic tree and Euclidean distance matrix derived from PCA. The phylogenetic tree presented deeply diverged discreet clades that largely correspond to the two putative species. Nevertheless, PCA revealed no distinct clustering of individuals. Unique maternal inheritance might explain the discrete mtDNA variations while nuclear gene based morphological variations were continuous. Mantal tests suggested the mtDNA and morphology diverged in concordance; both had evidence of a west to east clinal variation. We conclude that P. frontalis is a synonym of P. przewalskii . Furthermore, the Mantel test is a useful method to compare mtDNA data with morphological data, but insufficient to delimit species boundaries.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesCharge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,058
Score d'incertitude au seuil0,991

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,002
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0100,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,063
Tête enseignante GPT0,250
Écart entre enseignants0,187 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations13
Publié2011
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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