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Enregistrement W1598171260 · doi:10.1046/j.1432-1033.2003.03941.x

Differential carbohydrate epitope recognition of globotriaosyl ceramide by verotoxins and a monoclonal antibody

2004· article· en· W1598171260 sur OpenAlexaff
Davin Chark, Anita Nutikka, Natasha Trusevych, Julia Kuzmina, Clifford A. Lingwood

Notice bibliographique

RevueEuropean Journal of Biochemistry · 2004
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueEscherichia coli research studies
Établissements canadiensUniversity of TorontoHospital for Sick Children
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésGlobotriaosylceramideLactosylceramideChemistryFluorescein isothiocyanateGlycosphingolipidImmunostainingMolecular biologyBiologyBiochemistryPathologyImmunohistochemistryImmunologyMedicineGlycolipid

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The role of renal expression of the glycosphingolipid verotoxin receptor, globotriaosylceramide, in susceptibility to verotoxin-induced hemolytic uremic syndrome is unclear. We show that a single glycosphingolipid can discriminate multiple specific ligands. Antibody detection of globotriaosylceramide in renal sections does not necessarily predict verotoxin binding. The deoxyglobotriaosylceramide binding profile for verotoxin 1, verotoxin 2 and monoclonal anti-globotriaosylceramide are distinct. Anti-globotriaosylceramide had greater dependency on the intact alpha-galactose and reducing glucose of globotriaosylceramide than verotoxin 1, while verotoxin 2 was intermediate. These ligands differentially stained human kidney sections. Glomerulopathy is the primary verotoxin-associated pathology in hemolytic uremic syndrome. For most samples, verotoxin 1 immunostaining within adult glomeruli was observed (type A). Some samples, however, lacked glomerular binding (type B). Anti-globotriaosylceramide (and less effectively, verotoxin 2) stained all glomeruli. Verotoxin 1/anti-globotriaosylceramide tubular staining was comparable. Type B glomerular/tubular globotriaosylceramide showed minor, but significant, fatty acid compositional differences. Verotoxin 1 type B glomerular binding became evident following pretreatment with cold acetone, or methyl-beta-cyclodextrin, used to deplete cholesterol. Direct visualization, using fluorescein isothiocyanate-verotoxin 1B, showed paediatric, but no adult glomerular staining; this was confirmed by anti-fluorescein isothiocyanate immunostaining. Acetone induced fluorescein isothiocyanate-verotoxin 1B glomerular staining in type A, but poorly in type B samples. Comparison of fluorescein isothiocyanate-verotoxin 1B and native verotoxin 1B deoxyglobotriaosylceramide analogue binding showed an alteration in subspecificity. These studies indicate a marked heterogeneity of globotriaosylceramide expression within renal glomeruli and differential binding of verotoxin 1/verotoxin 2/anti-globotriaosylceramide to the same glycosphingolipid. Verotoxin 1 derivatization can induce subtle changes in globotriaosylceramide binding to significantly affect tissue binding. Heterogeneity in glomerular globotriaosylceramide expression may play a significant (cholesterol-dependent?) role in determining renal pathology following verotoxemia.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,603

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,010
Tête enseignante GPT0,255
Écart entre enseignants0,245 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations55
Publié2004
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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