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Enregistrement W1598171260 · doi:10.1046/j.1432-1033.2003.03941.x

Differential carbohydrate epitope recognition of globotriaosyl ceramide by verotoxins and a monoclonal antibody

2004· article· en· W1598171260 sur OpenAlexaff
Davin Chark, Anita Nutikka, Natasha Trusevych, Julia Kuzmina, Clifford A. Lingwood

Notice bibliographique

RevueEuropean Journal of Biochemistry · 2004
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueEscherichia coli research studies
Établissements canadiensUniversity of TorontoHospital for Sick Children
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésGlobotriaosylceramideLactosylceramideChemistryFluorescein isothiocyanateGlycosphingolipidImmunostainingMolecular biologyBiologyBiochemistryPathologyImmunohistochemistryImmunologyMedicineGlycolipid

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The role of renal expression of the glycosphingolipid verotoxin receptor, globotriaosylceramide, in susceptibility to verotoxin-induced hemolytic uremic syndrome is unclear. We show that a single glycosphingolipid can discriminate multiple specific ligands. Antibody detection of globotriaosylceramide in renal sections does not necessarily predict verotoxin binding. The deoxyglobotriaosylceramide binding profile for verotoxin 1, verotoxin 2 and monoclonal anti-globotriaosylceramide are distinct. Anti-globotriaosylceramide had greater dependency on the intact alpha-galactose and reducing glucose of globotriaosylceramide than verotoxin 1, while verotoxin 2 was intermediate. These ligands differentially stained human kidney sections. Glomerulopathy is the primary verotoxin-associated pathology in hemolytic uremic syndrome. For most samples, verotoxin 1 immunostaining within adult glomeruli was observed (type A). Some samples, however, lacked glomerular binding (type B). Anti-globotriaosylceramide (and less effectively, verotoxin 2) stained all glomeruli. Verotoxin 1/anti-globotriaosylceramide tubular staining was comparable. Type B glomerular/tubular globotriaosylceramide showed minor, but significant, fatty acid compositional differences. Verotoxin 1 type B glomerular binding became evident following pretreatment with cold acetone, or methyl-beta-cyclodextrin, used to deplete cholesterol. Direct visualization, using fluorescein isothiocyanate-verotoxin 1B, showed paediatric, but no adult glomerular staining; this was confirmed by anti-fluorescein isothiocyanate immunostaining. Acetone induced fluorescein isothiocyanate-verotoxin 1B glomerular staining in type A, but poorly in type B samples. Comparison of fluorescein isothiocyanate-verotoxin 1B and native verotoxin 1B deoxyglobotriaosylceramide analogue binding showed an alteration in subspecificity. These studies indicate a marked heterogeneity of globotriaosylceramide expression within renal glomeruli and differential binding of verotoxin 1/verotoxin 2/anti-globotriaosylceramide to the same glycosphingolipid. Verotoxin 1 derivatization can induce subtle changes in globotriaosylceramide binding to significantly affect tissue binding. Heterogeneity in glomerular globotriaosylceramide expression may play a significant (cholesterol-dependent?) role in determining renal pathology following verotoxemia.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,010
Tête enseignante GPT0,255
Écart entre enseignants0,245 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations55
Publié2004
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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