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Enregistrement W1598382305 · doi:10.5772/31629

Folding and Aggregation of Cu, Zn-Superoxide Dismutase

2012· book-chapter· en· W1598382305 sur OpenAlexaff
R. Saibil Helen, Alison K. Heather, Jessica A.O., Brian J. Peter, Anthony Kenrick, Young‐Mi Hwang, M. Elizabeth

Notice bibliographique

RevueAmyotrophic Lateral Sclerosis · 2012
Typebook-chapter
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueAmyotrophic Lateral Sclerosis Research
Établissements canadiensUniversity of Waterloo
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésSuperoxide dismutaseFolding (DSP implementation)ChemistryDismutaseBiophysicsBiochemistryBiologyOxidative stressEngineering

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Introduction ALS and SOD1In 1993, a genetic link was established between amyotrophic lateral sclerosis (ALS) and mutant forms of Cu,Zn superoxide dismutase (SOD1) (Deng et al. 1993;Rosen et al. 1993), an antioxidant enzyme that catalyzes the dismutation of the damaging free radical superoxide anion (O 2 -) to hydrogen peroxide (H 2 O 2 ) and diatomic oxygen (O 2 ) via cyclic reduction and oxidation of a protein-bound Cu ion (Valentine et al. 2005).Today, over 150, predominantly missense mutations have been identified at ~75 sites spread throughout the protein (http://alsod.iop.kcl.ac.uk/).SOD1 mutations are found in ~15-20% of inherited or familial ALS (fALS) cases and in a small percentage of sporadic ALS (sALS) cases (Rosen et al. 1993;Kato et al. 2000;Liu et al. 2009;Forsberg et al. 2011).fALS accounts for ~10% of all ALS cases and so SOD1 mutations comprise ~1.5-2% of all ALS cases, but nevertheless represent a major known cause of the disease.The clinical symptoms of fALS and sALS are similar, yet fALS patients with SOD1 mutations have an earlier age of disease onset than sALS (by ~10 years) (Wijesekera and Leigh 2009).Furthermore, while the age of disease onset has not been identified as statistically different between different SOD1 mutations, disease duration for each mutation is often different, ranging from shorter (e.g.~1 year for A4V, the most common mutation in North America) than the typical 3-5 years to longer (e.g.~18 years for H46R) (Cudkowicz et al. 1997;Valentine et al. 2005;Wang et al. 2008).In humans and murine models of ALS, mutations in the gene encoding SOD1 are typically autosomal dominant and are associated with a toxic gain of function.Despite extensive research, the molecular basis for mutant SOD1 toxicity remains unclear (Valentine et al. 2005;Boillee et al. 2006;Ilieva et al. 2009).Extensive research has been conducted on SOD1-linked fALS, as understanding and treatment of this disease may be relevant to ALS in general.While ALS patients share many clinical symptoms, numerous genes have been linked to ALS, and there is evidence for differences in pathology related to both genetic and environmental factors; hence, ALS is a syndrome and not a single disease with unique pathology (Cozzolino et al. 2008).www.intechopen.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict), Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,796
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,048
Tête enseignante GPT0,264
Écart entre enseignants0,216 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations9
Publié2012
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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