To Be Drug or Prodrug: Structure-Property Exploratory Approach Regarding Oral Bioavailability
Notice bibliographique
Résumé
PURPOSE: Prodrug design is a strategy that can be used to adjust physicochemical properties of drugs in order to overcome pharmacokinetic problems, such as poor oral bioavailability. However, Lipinski´s and Veber´s rules predict whether compounds will have absorption problems even before the design of prodrugs. In this context, our goal was to evaluate the molecular properties which most influenced the absorption process of prodrugs compared to its precursor through exploratory data analysis approach. METHODS: A variety of prodrugs and respective precursors were randomly selected and classified by its percentage of human intestinal absorption. Subsequently, different molecular properties were calculated and hierarchical cluster analysis (HCA) and principal components analysis (PCA) were carried out. RESULTS: According to the findings, antiviral, anti-hypertensive, and antibiotic prodrugs exhibited higher absorption levels than their respective precursors. Also, some relevant descriptors (molecular weight, MW, routable bonds, rot_bonds, hydrogen bond acceptors, HBA_count and polar surface area, PSA), which are included in Lipinski´s and Veber´s rules, influenced the separation process between prodrugs and drugs. Furthermore, other molecular properties, such as polarizability (α) and molar refractivity (MR), were pointed out. CONCLUSION: Lipinski´s and Veber´s rules proved to be important to design an orally administered drug but other descriptors should be considered by medicinal chemists in the prodrug designing process.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,009 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,002 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,001 |
| Communication savante | 0,001 | 0,003 |
| Science ouverte | 0,003 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».