Variation in <scp>MHC</scp> class <scp>II B</scp> genes in marbled murrelets: implications for delineating conservation units
Notice bibliographique
Résumé
Abstract Conserving genetic variation is critical for maintaining the evolutionary potential and viability of a species. Genetic studies seeking to delineate conservation units, however, typically focus on characterizing neutral genetic variation and may not identify populations harboring local adaptations. Here, variation at two major histocompatibility complex ( MHC ) class II B genes was characterized in four populations of marbled murrelets B rachyramphus marmoratus , a threatened species in which little neutral genetic population structure has been detected. High diversity, as well as evidence of balancing selection, was detected in exon 2 of these genes. Genetic population structure based on MHC markers was uncorrelated to genetic structure estimated with neutral markers, suggesting that selection played a more important role in shaping population structure at these markers than genetic drift. A high proportion of alleles and inferred peptides were unique to a single population, with the A leutian I slands and southeast A laska having the highest richness of both. Murrelets sampled in O regon had low MHC exon 2 allele and inferred peptide richness, and were significantly differentiated from individuals sampled in the A leutian I slands based on the frequency of exon 2 alleles. In addition, murrelets sampled in O regon were differentiated from murrelets in both the A leutian I slands and southeast A laska based on inferred peptide frequencies, suggesting that the O regon population could be prioritized for conservation measures. More broadly, combining information from neutral and adaptive genetic markers can improve the delineation of conservation units in threatened species.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,002 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».